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Science:科学家阐明III型CRISPR/Cas系统靶向作用RNA分子的特殊机制
近年来CRISPR技术已经迅速转变成了一种RNA编辑工具,同时其也是一种基因组编辑工具,近日,来自加利福尼亚大学的研究人员在刊登在Science上的一篇研究报告中揭示了一种特殊的蛋白质结构,其可以使得CRISPR/Cas靶向作用的RNA突变分裂单链的RNA分子。 目前已知有三种RNA引导的CRISPR/Cas系统:I型和II型...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(下)
上周我们一起回顾了3篇关于RNA序列捕获的研究文章,这周我们再来看3篇近期发表的文献: 1.Nat Biotechnol. 2014 Sep;32(9):903-14. doi: 10.1038/nbt.2957. Epub 2014 Aug 24. A comprehensive assessment of RNA-seq accuracy, r...
检测循环肿瘤细胞中miRNA的新技术
越来越多的证据表明,循环肿瘤细胞(CTC)中的micrornA具有诊断和预后的潜力。然而,检测却并非易事。近日,西班牙的研究人员在《Science Reports》上介绍了一种方法,能利用原位杂交检测这种小的非编码RNA。 CTC是从原发性肿瘤脱落,然后进入循环系统的一种细胞。它们到达其他的组织或器官,导致肿瘤转移。鉴于近年来CTC检测技术的进步,研究人员能够利用这些上皮细胞来监测癌症进...
Nat Bio:新单细胞mRNA测序揭示大脑皮层细胞发育的独特性
加州大学旧金山分校的研究人员利用新的单细胞分析方法研究大脑皮层细胞的独特性,识别不同细胞类型的数百个新型生物标志物,这一项成果将提高科学家们对于出现特化神经元亚型的理解。这种集中于单细胞基因活性的新方法,最终与其他单细胞技术(包括显微成像)相结合,可能会揭示脑部发育障碍的起源。相关文章发表于2014年8月3日的《Nature Biotechnology...
科学家利用微RNA修复小鼠受损心肌 有望应用到人身上
心肌修复,请找微RNA(核糖核酸)。中美科学家的一项新研究发现,给心脏病发作的小鼠注射一种微RNA分子,可以刺激小鼠心脏长出新的细胞。这种受损心脏修复法有望应用到人身上。 与其他器官不同,哺乳动物的成年心肌细胞不具备增殖能力,因而其心脏受损后不能再生。但美国天普大学、宾夕法尼亚大学和中国第四军医大学的研究人员在美国《科学-转化医学》杂志上报告说,他们发现一种名为miR302-367的微R...
盘点RNA序列捕获最新出炉文献(上)
上周末,一篇利用对lncRNA的捕获测序进行癌症研究的文章吸引了大家的眼球。其实这种针对lncRNA的捕获测序,正是利用罗氏NimbleGen最新上市的产品SeqCap RNA序列捕获探针库实现的。SeqCap RNA与传统外显子捕获测序方法几乎完全相同,然而当被捕获的文库从基因组变成了转录组,则可发现许多转录本可变剪切信息以及一些低丰度的转录本。 ...
HCV会螯合肝脏中的microRNA
洛克菲勒大学的研究人员近期报道称:最新的数据显示乙型肝炎病毒(HCV)在肝脏中扮演着螯合肿瘤抑制microRNA的角色,这为解释HCV与肝癌的关系提供了更进一步的线索。 MiR-122是一种特异性存在于肝脏中的miRNA,它与脂肪与肝脏的新陈代谢相关,但是它也被证明是HCV复制所需要的宿主因子。具体来说,病毒会富集R...
PNAS:新研究扩大了人类microRNA的数量
在公共数据库中,人类基因组产生microRNA的位置大约有1900处,而Thomas Jefferson大学的最新研究表明,这个数字将会是更加庞大的。 结果还表明,这些新的位点中,很多都是具有人类和组织特异性的,这将对疾病中miRNA的作用研究产生巨大的影响。 自从二十年前第一次发现miRNA...
不明觉厉新型生命暗物质与疾病有关 神秘暗物质的由来分析
【新型生命暗物质】非编码RNA(核糖核酸),被称为生命体中“暗物质”。日前,中国科学技术大学单革教授实验室发现一类新型环状非编码RNA,并揭示了此类非编码RNA的功能和功能机理。成果发表在国际知名杂志《自然·结构和分子生物学》上。非编码RNA是一大类不编码蛋白质,但在细胞中起着调控作用的RNA分子。 不明觉厉新型生...
Journal of Clinical Microbiology:研究人员开发出基于Simoa,用于检测登革热宿主免疫反应的实验
在这项研究中,其结果本周已经在线发表在《Journal of Clinical Microbiology》上,Tufts小组描述了基于Simoa发展的实验,其能够检测2型抗登革热IgG和IgM,并且比较了其与另外两种抗体的市售ELISA试剂盒的灵敏度。 该比较表明,Simoa方法比一种试剂盒灵敏度高1000被,其另一种高10000倍。 根据该组的说明,目前使用的ELISA抗登革热抗...
Nature子刊:新数据表明,miRNA的基因编辑与黑色素瘤的生长转移有关
尽管研究结果仅仅限于黑色素瘤,但是参与该研究的人就人员认为,这种机制也有可能在其他类型的癌症中发现。这些出现在《Nature Cell Biology》上的数据,也可能成为治疗癌症的新的靶点。 A-I编辑是RNA编辑中最常见的一种形式,其是由作用于RNA(ADAR)的腺苷脱氨酸酶的活性介导的。此类RNA编辑发生在例如miRNAs等调节RNAs中,在2013年Wistar研究所的一个团队报...
PNAS:新发现两种帕金森的miRNA生物标记物
通过四个基因芯片研究的汇总分析,Rosalind Franklin大学医学和科学中心的研究人员确定了两种miRNAs,可以作为帕金森综合症的生物标记物。 相比于对照组,HNF4A和PTBP1的mRNA在帕金森综合症患者的血液中具有不寻常的表达水平,该研究结果近日发表在了《Proceedings of the National Aca...
小鼠睾丸中MIWI/piRNA介导了mRNA的剪切
最新一期的国际学术期刊《Cell Research》在线发表了由中科院动物所和中科院生化细胞所共同完成的在小鼠生精细胞发生中MIWI/piRNA的功能机制的研究论文,报道了在小鼠睾丸中piRNA发挥着类似siRNA的功能,可以指导MIWI对于mRNA的剪切,保证小鼠配子的正常生成。本项研究工作是由中科院北京动物研究所何顺明实验室、上海生物化学及细胞生物学所刘默芳实...
痰液中的miRNAs或成为肺癌的生物标记物
非小细胞肺癌(NSCLC)在美国依然是造成癌症死亡最多的种类,而去年大约有16万美国人死于其。由于早期的治疗可以显著的改善患者的预后,重度吸烟者和患有其他风险的人群会使用低剂量的计算机断层扫描来进行疾病的筛选。虽然其是有效的,但是CT筛查是昂贵的,耗时的,而且,最重要的是,其会造成过度诊断,因为其进场解释非癌性病变,或孤立性肺结节,或者恶性的。 “现在,我们面临的挑战是在通过CT发现阳性...
Moderna融资4.5亿美元,掌握颠覆性生物制药技术
总部位于马萨诸塞州剑桥市的生物科技公司Moderna Therapeutics在本周早些时候宣布,该公司在新一轮融资中募集4.5亿美元,其投资者包括维京全球投资(Viking Global Investors LP)、Invus、RA资本管理(RA Capital Management)、威灵顿管理公司(Wellington Management Company, LLP)...
PNAS:lncRNA可作为白血病预后标志物
最近,美国俄亥俄州立大学综合癌症中心- Arthur G. James肿瘤医院和Richard J. Solove研究所(OSUCCC - James)研究人员带领的一项新研究,描述了一种新的标志物,可能帮助医生为许多急性髓细胞白血病(AML)老年患者选择毒性最小、最有效的治疗方法。AML好发于老年人,中位发病,年龄为65~70岁,35%新诊断的AML患者年龄≥75岁,三年...
血清miRNA可用于早期诊断糖尿病
II型糖尿病(T2D)是一种代谢紊乱症,其特点是高血糖并伴有胰岛素敏感性下降以及胰岛素抗性。II型糖尿病约占所有糖尿病的90%。因此糖尿病的早期、快速、灵敏的诊断成为一种迫切的需求。 MicroRNA(miRNAs)作为一类重要的转录后基因表达调控元件,在T2D发病中起重要作用,可以调节多种代谢途径包括胰岛素分泌,葡萄糖体内平衡等。近来的研究...
循环血中microRNAs可作为多发性骨髓瘤预后工具
美国血液学会(ASH)在年会上公布了由达纳法博癌症研究中心研究人员所做的研究。这项研究根据多发性骨髓瘤细胞内的microRNA,了解了这种患者对治疗做出的反应。 这项研究的作者说,这项研究最终有可能会指导医生如何选择骨髓瘤的最佳疗法。 肿瘤的外体是指细胞释放到血液中、能介导细胞间信息传递的微小囊泡。这项研究主要针对的就...
Dicerna将与Tekmira合作,为其带来2450万美元收入
制药公司Dicerna将许可Tekmira制药使用其纳米脂粒技术(LNP)来研发DCR-PH1,即Dicerna的罕见肝病1型高草酸尿症(PH1)的主要临床实验药物。Dicerna在最近的声明中表示,这笔交易可能为Tekmira带来包括版税在内的高达2450万美元的收入。协议将在DCR-PH1结合Tekmira的LNP技术于包括老鼠和非人类的灵长类动物在内的动物模型上测试成...
Fluidigm推出高通量单细胞mRNA测序流程
Fluidigm公司近日在美国神经科学学会的会议上宣布推出一个新流程,能实现高通量的单细胞mRNA测序。这个流程综合了集成流体通路(IFC)设计的显著进步,可大规模提高通量和易用性,同时降低单细胞制备的成本。据介绍,商业化的产品有望在2015年上半年推出。 Fluidigm的CEO Gajus Worthington...