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专家访谈
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Nature：如何利用单细胞mRNA测序发现罕见细胞类型？
近日，来自荷兰的科学家在著名国际学术期刊nature上发表了一项最新研究进展，他们利用一种新的计算方法结合转录组测序发现了小肠中一些罕见的细胞类型，这对于深入了解器官的细胞组成，探究健康和疾病状态下的组织生物学具有重要意义。 理解一个器官的发育和功能需要对组成该器官的所有细胞类型的特性有一个清晰的认识。传统发现和分离细胞亚群的方法是基于几个已知的标记...
浙江大学李兰娟院士权威期刊发表miRNA研究新成果
来自浙江大学医学院的研究人员报告称，她们在新研究中确定了乙型肝炎相关慢加急性肝衰竭(acute-on-chronic liver failure,ACLF)外周血单核细胞miRNA的特征。研究结果发布在8月12日的《Scientific Reports》杂志上。 浙江大学医学院的李兰娟(Lanjuan Li)院士、林标杨（ Biaoyang ...
Genome Research全面解读基因组miRNA
MicroRNA（miRNA）在调控基因表达中起到了关键性作用，涉及了许多生理学和病理学过程。 成熟miRNA只有大约22个核苷酸，但它们的转录本可以长达数百kb。初级miRNA转录本（或pri-miRNA）很快就会被加工为成熟miRNA，导致RT-PCR、RNA测序等标准检测方法的灵敏度不高。由于不了解miRNA基因的启动子或剪切位点，人们...
Journal of neuroscience：脑神经调节也“男女有别”
近日，来自美国西北大学的研究人员在对参与学习记忆和应激应答的脑部区域进行研究之后发现雄性和雌性的脑在分子水平上存在着不同的运作方式。相关研究结果发表在国际学术期刊journal of neuroscience上。 许多脑紊乱疾病的发生都在不同性别之间存在差异，但其中隐含的生物学过程是如何促进这些差异的产生仍然是一个迷。来自西北大...
我国科学家发现引发胃癌的特殊microRNA分子—miR-7
近日，来自中国第四军医大学的研究人员通过研究发现，microRNA 分子miR-7可以通过抑制一种关键的信号通路来抑制胃癌的发生，而这种关键的信号通路对于幽门螺杆菌而言是一种保护性的机制，该研究或为后期讯号诱导子miR-7表达进而来有效抑制胃癌的新型药物或疗法的开发提供新的线索和研究思路。 据国立卫生研究院数据显示，胃癌是常见的四种癌症中的一种，而且其是全世界癌症死亡...
Startup Vajra计划研发新的用于癌症诊断的microRNA检测工具
Vajra，是一家出自内布拉斯加大学林肯分校的公司，其建立主要依赖一种用于电双层或者SEED的静电计，这种仪器可以在整块电极上检测多种酶的反应，这种技术是基于使用各自的分析物混合进行的免疫特异性结合实现的。 根据Vajra创始人和UNL研究人员Ravi Saraf的说法，SEED能够通过激光扫描，在整块电极上通过固定的单层斑点酶阵列定量标记氧化还原反应。之后会...
清华大学Nature子刊发布mRNA研究新方法
来自清华大学、哥伦比亚大学的研究人员报告称，他们开发出了一种叫做mRIN的新方法，可用于直接评估来自大型RNA测序数据全基因组及基因特异性mRNA的完整性。这一重要的研究成果发布在8月3日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 哥伦比亚大学系统生物学系助理教授张朝林（Chaolin Zhang）是这篇论文的通讯...
Nature Methods发布新RNA测序技术
Santa Cruz公司和Rochester大学的研究人员开发了一种新的RNA测序技术。他们通过这一技术发现了许多此前未被检测到的调控性小RNA。这一成果发表在八月三日的Nature Methods杂志上。 这个新技术可以在细胞中灵敏检测到带有化学修饰（甲基化）的小RNA。“tRNA是生物体内含量最丰富的小RNA之一，细胞里到处都是tRN...
清华汪小我等人开发CRISPR sgRNA设计工具
CRISPR/Cas9系统，是最近开发的一种强大而灵活的靶向基因组工程技术，包括基因组编辑和基因调控。这些应用需要设计高效、特异的单向导RNA（sgRNA）。然而，这仍然是具有挑战性的，因为它需要考虑许多标准。已有研究开发出了一些sgRNA设计工具用于基因编辑，但是目前还没有设计出用于基因调控的sgRNA设计工具。 七月二十三日，清华大学...
潘滔教授Nature Methods发布RNA测序重大突破
来自芝加哥大学、德克萨斯大学奥斯汀分校的研究人员报告称，他们开发出了一种新方法实现高效定量高通量tRNA测序。这种叫做DM-tRNA-seq的技术适用于在所有生物体中开展tRNA研究。这一重要的研究成果发布在7月27日的《自然方法》（Nature Methods）杂志上。 芝加哥大学生物化学和分子生物学教授潘滔（Tao Pa...
Genome Biology：RNA-seq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初，新一代测序技术只产生25或36...
Genome Biology：RNA-seq需要多长的读长？
随着新一代测序（NGS）的读长在不断增长，研究人员也开始纠结：到底多长的读长才合适？双端测序是不是优于单端测序？近日，康奈尔大学维尔医学院的研究人员在《Genome Biology》杂志上发表文章，认为对于差异表达分析而言，读长并非越长越好。不过，双端测序和长的读长无疑能改善剪接的检测。 最初，新一代测序技术...
在NCI的资助下，贝勒大学开始开发基于microRNA的结直肠癌筛查技术
这项研究的首席研究员，贝勒大学的研究人员Ajay Goel 说道，该获得了国家癌症研究所五年的资助，有望在数千名患者中进行这项前瞻性的研究，并且该研究具有商业化的潜力。 CRC是全球导致死亡第二多的癌症种类，部分原因是由于其具有高转移性。而如果在治疗的早期过程中发现癌症，那么患者可以在其癌变之前获得更好的治...
PNAS重大突破：强大的RNA研究工具
RNA是所有已知生命形式一个基础的组成部分――因此当RNA出错之时，许多事都可能会出错。RNA错误调控在许多疾病如精神障碍、自闭症和癌症的发病中都起着重要的作用。 现在来自美国西北大学的纳米医学专家开发出了一种叫做Sticky-flares的新技术，提供了第一个实时追踪和观察RNA传送到活细胞内时分布动态的新方法。 ...
Nature子刊：miRNAs是血脑屏障的保护者
且不论潜在的损伤机制，中枢神经系统的病理情况都会显示一定程度的血脑屏障（BBB）受损。血管内皮功能障碍是血管损伤起始的最早事件，是由中风、动脉粥样硬化、外伤或是脑部感染引起的炎症造成的。现今，microRNAs（miRNAs）已成为一类基因表达的调节子。然而，神经炎症与脑内皮细胞中miRNAs表达之间的关系仍然未知。此前的研究表明，在神经炎症的体外和体...
上海交大Nature子刊发布miRNA研究新发现
来自上海交通大学医学院的研究人员在新研究中证实，miR-31通过抑制维甲酸诱导蛋白3（又称作Gprc5a）负向调控了外周血Treg细胞（pTreg）生成。这一重要研究发现发布在7月13日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 论文的通讯作者是上海交通大学医学院的王宏林（Honglin Wang）教授。王教授是...
JournalofExperimentalMedicine：开启长期免疫的"分子开关"
墨尔本大学研究人员最近发现了一个能负责保存抗体产生细胞的蛋白，使得身体在感染或者疫苗接种后，能保持长久的免疫状态。Kim Good-Jacobson医生，David Tarlinton教授和其他来自the Walter and Eliza Hall Institute的研究人员们一起发现了一种叫做Myb蛋白质的存在，是抗体生成浆细胞迁移到骨髓过程中所必不可少的，能够使它们在骨...
细胞外RNA提取试剂盒究竟哪家强？
细胞外RNA（exRNA）已成为研究界的新宠。近年来，人们在血浆或血清样本中成功检测到疾病相关的exRNA，使其有望成为非侵入性的生物标志物。然而，从血浆或血清中分离exRNA仍颇具挑战性，这一方面是因为exRNA丰度低，另一方面是因为血液中的污染物会抑制PCR。 商品化的试剂盒能简化和加速exRNA提取过程，已成为循环exR...
中国医学科学院Nature子刊：促进再生的miRNA
来自中国医学科学院的研究人员证实，在小鼠中一种叫做miR-431的小RNA分子可以通过靶向Pax7来促进肌肉再生，改善肌营养不良。这一重要的研究发现发布在7月7日的《自然通讯》（Nature Communications）杂志上。 中国医学科学院的朱大海（Dahai Zhu）教授以及张勇（Yong Zhang）是这篇论文的共同通讯作者。朱...
Science子刊：RNA测序诊断男性不育症
男性不育症是一种男性常见疾病，其发病率在10%左右。精子缺失或形状、质量问题是目前临床上确诊男性不育症最常见的原因。然而长期以来让科学家们疑惑是部分的男性不育症患者似乎并不存在精子的质量和数量问题，那么如何在临床上判断男性不育，从而加以干预呢？ 目前的方法主要是通过精液检测，但正如上文所述，部分的男性不育症患者似乎并不存在精子...