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Fluidigm携欧洲机构开展单细胞基因组学研究

2014-12-18

  流体芯片商Fluidigm今天宣布了与威康信托基金会桑格研究所及欧洲生物信息学研究所的一项合作协议,共同开发单细胞基因组数据的新型分析方法。   Fluidigm高级研究人员将在英国斯顿的桑格研究所单细胞基因组学中心实地工作,为该机构提供最新的设备、工作流、基因组学和蛋白质组学的方法研究。   桑格研究所和欧洲分子生物学室验室的资...

Eagle助力宝洁 实现基因组与生物信息学的跨领域应用

2014-12-13

  宝洁(P&G)签订了一份为期四年的协议,使用生物信息学软件来帮助其促进包括制药、消费品和生物燃料等新产品的开发。   该公司将使用Eagle Genomics公司的云端安全系统Eaglecore平台整合现有的数据,并对公司现有数据重新进行分析和集成。   Eagle公司CEO Abel Ureta-Vidal博士在声...

ICGC应用云平台深化开放其癌症基因组数据

2014-12-13

  国际癌症基因组协会(ICGC)在声明中表示已经选择了Annai系统在1万个ICGC所产生的人类癌症基因组项目中进行数据收集。   ICGC数据都会出现在基于云平台ShareSeq的Annai系统中,该系统将在短期内增加额外功能,支持研究人员联合分析他们自己的研究数据与ICGC数据库中的数据。   根据ICGC的声明,该项举措...

【GEN】2015年全基因组测序(WGS)6大应用预测

2014-12-12

  Illumina宣布HiSeq X Ten测序系统将会于1月份重磅回归,该技术的早期运用还需要等待一段时间,然而GEN预测了Illumina X Ten在2015年可能会实现的6大应用。Illumina X Ten的测序功能非常强大,一台机器一年能完成18000个人类基因组测序,尽管大规模基因组测序还会面临一系列挑战,但是现在可以将这些顾虑暂时搁置,思考一下科学家们可...

黑莓手机合作打造个人癌症基因组浏览器

2014-12-10

  黑莓公司是智能机领域的先驱,但由于近年在手机业务上的低迷表现,黑莓正不断寻求业务转型,力图探索新的发展点。今年4月,黑莓公司曾宣布已买入少量NantHealth股份,欲与其联手合作推出一款侧重医疗保健的智能手机。   在2014年即将结束之际,NantHealth公布了应用于黑莓Passport智能手机上的NantOmi...

NIH:1800万美元奖励疟原虫单细胞基因组学研究

2014-12-10

  NIH奖励德克萨斯生物医学研究院的科学家Ian Cheeseman 1800万美元,以鼓励其继续进行疟原虫单细胞基因组的研究。   Ian Cheeseman及其研究团队开创了一种新的检测方法,可对单个疟原虫的基因组进行测序,该方法发表在今年五月份的Genome Research杂志上。方法结合了细胞分选、全基因组扩增基因分型以及...

近期最热的基因组测序新成果

2014-12-09

  The scientist杂志盘点了近期各大杂志上最热门的基因组测序成果,中国团队的几项测序研究受到了广泛关注。   种属:兰花(Phalaenopsis equestris)   基因组:约1.2 billion bp   我国研究团队于十一月二十四日在Nature Genetics杂志上发布了小兰屿...

Congenica获160万美金用于基因分析平台开发

2014-12-06

  生物信息学公司Congenica今天宣布,它已从剑桥创新资本收到100万英镑(160万美元)的注资用于建立其 Sapientia平台。   Sapientia是一个和可伸缩的模块化数据分析工具,主要用于解释临床基因组序列数据。   Congenica创始人之一Matthew Hurles在一份声明中表示:“Sapientia...

MIT和麻省总医院建立新的微生物基因组学研究中心

2014-12-05

  麻省理工MIT和麻省总医院11月份宣布投资2500万美元创办新的微生物基因组学生物信息和治疗研究中心,旨在为双方的科研人员提供研究平台以探索人类疾病与体内微生物之间的联系。这项研究炎症性肠病的旗帜性项目包含数个小的创新项目,其目的很明确,即开发新的治疗方法并将其带入临床检测应用。   这个项目的创办受到了对微生物基因组学治疗方案拥...

Cell:迄今最大人类基因组编码蛋白相互作用图谱问世

2014-12-03

  据最新一期《细胞》杂志报道,由加拿大和美国科学家组成的一个国际研究小组,绘制出了迄今最大规模的人类基因组编码蛋白间直接相互作用的图谱,并预测出数十个与癌症相关的新基因。该项研究成果对于理解癌症和其他疾病的形成机制,并最终开发出治疗和预防方案至关重要。   加拿大高等研究院、美国达纳法博癌症研究中心和哈佛医学院共同完成的...

11月王牌聚焦:各种重大图谱成果扑面而来

2014-12-01

  时近年末,各种重大成果好似扎堆一样接踵而来,人类蛋白质互作组图谱、人类基因组重组图谱、ENCODE重大成果接连公布,让人眼花缭乱,科学界“过年”的氛围扑面而来。   首先是科学家们公布了迄今为止最大规模的人类基因组编码蛋白直接互作图谱,并预测出了与癌症相关的几十个新基因。这一新“人类互作组(interactome)”图谱描述了蛋白质之间的1.4万...

Genomics新轮融资 参与十万基因组计划

2014-11-27

  根据今天发布的一份投资者声明,英国Genomics有限公司将在一项融资中首轮提出1030万欧元的私人融资。   Genomics有限公司是英国牛津大学的一家衍生公司,正在开发一个基因组序列数据分析平台。该公司创始人之一彼得·唐纳利是牛津大学教授,同时也是威康信托基金会以及吉尔麦卡文金融集团人类遗传学中心主任。以上两个金融集团的人类遗传学中心皆由牛津纳米...

新型DNA分析器引领个性化医疗时代

2014-11-26

美国亚利桑那州立大学生物设计研究所和IBM的T.J.沃森研究中心的研究人员在一项声明中表示他们已经开发出一个能够分析整个基因组的原型DNA分析器,该分析器可实时捕捉医疗过程中产生的生物学信息。 亚利桑那州立大学物理学教授和生物设计单分子生物物理学中心主任Stuart Lindsay博士表示:“我们的目标是把廉价、简单和强大的DNA和蛋白质诊断设备进每一个医生的办公室。” ...

Sanger团队成功测序人脑绦虫

2014-11-22

  惠康基金会Sanger研究所为中心的研究机构对欧猥迭宫绦虫进行了测序和蛋白组学的草图绘制,研究样本来自病人大脑中匍匐着的绦虫。   根据研究团队今天在Genome Biology 网络版的报告,研究人员通过针对性条码基因测序技术找到了引起患者症状的脑绦虫,该患者年龄为50岁并长期患有头痛和神经疾病。研究人员对绦虫样本进行了基因组测序,得到了一个总数据量高达1260万的欧猥迭宫绦虫基因组装配草...

研究者在哺乳动物基因组中发现细菌基因

2014-11-21

由约翰霍普金斯大学Steven Salzberg教授领导的研究团队本周在科学期刊PeerJ上发表文章表示环境中例如细菌序列的核酸污染物可能在哺乳动物基因组中进行装配,即使这些序列已经被公共数据库所收纳。 通过使用微生物学分析软件,Salzberg和他的同事们发现了美国奶牛基因组中包含了173个已经被证实的细菌核酸污染物微小相的邻片段,这些来自包括不动杆菌、假单胞菌以及寡养食单...

埃博拉基因测序难为“无米之炊”

2014-11-20

  随着埃博拉病毒横扫西非,科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测:这种病毒会变得更具传染性和更致命吗?它会发生变化,让其逃避诊断测试或疫苗吗?非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本,但它们并未被使用,且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。   研究人员渴望近距离观察病毒可能是如何进化的。英国爱丁堡大学研究传染病的进...

NATURE:白金基因组计划为疾病治疗带来曙光

2014-11-20

  “这就像欧洲测绘,有人说,‘噢,还有挪威。我真的不想要做那个地方。’”在英国剑桥附近的欧洲生物信息学研究所的计算生物学家Ewan Birney这样说道,其参与了人类基因组计划。“现在,终于有人在那里测量这个被忽略的地方了。”   这个方案依赖于一种奇特的细胞生长中得到的DNA,我们正在努力揭示之前官方人类基因组序列没有发现的DNA序列,而这些序列往与例如孤独...

GIS利用BT云计算技术促进全球基因组研究发展

2014-11-19

  新加坡基因组研究所(GIS)利用BT集团云计算等基础设施支持其现有的基因组分析功能发展。   根据协议条款,GIS将访问英国生命科学专用电信云计算基础设施,并将使用该系统运行计算密集型工作负载。GIS执行董事Ng Huck Hui在一项声明中表示“这将有助于GIS加快发展和商业化算法开发和数据库分析的临床应用,可用于探索疾病病因。” &emsp...

CG新技术在罕见病诊断上的应用

2014-11-19

  罕见病,顾名思义,是指那些仅发生在极少数人身上的罕见疾病。大部分的罕见病都是慢性的遗传疾病,由突变或遗传的基因缺陷而引起。就目前而言,许多罕见病都缺乏有效的治疗手段和资源,且往往非常严重,因此,罕见病的诊断和预防就显得十分重要。   2014年11月7日,第二届国际罕见病研究联盟会议在深圳福田大中华喜来登酒店召开。来自欧洲、美洲、非洲和亚洲的超过600...

雪貂基因组测序加深人类疾病研究

2014-11-18

      近日,一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。           研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达,通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。           基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份声明中表示“通过创建一个...