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诺奖得主:全基因组、大数据并非灵丹妙药

2014-10-08

  沃特·吉尔伯特因为与弗雷德里克·桑格发展了测定DNA序列的方法“测定核酸序列”,而在1980年获得诺贝尔化学奖。在2014年 Lindau Nobel Laureates 大会上接受记者采访。   问:您获得诺贝尔奖的时候,是否想过人类可以以低廉的价格获得个人基因组?   答:测序技术肯定会越来越便宜和便...

陈润生院士:生物大数据的核心是基因组数据

2014-09-30

  在2014年9月26日举行的生物大数据战略研讨会上,中国科学院生物物理研究所陈润生院士发表了精彩演讲。他从自己的研究工作出发,探讨了大数据的重要性及其所能带来的创新。其报告内容整理如下:   生物大数据最核心的部分是组学数据,而组学数据中最基础的数据是基因组数据,有了近年的基因组研究才派生出蛋白质组、代谢组、生物网络,也正是因为基因组的研究,才使得生物大数据实实在在地...

一场塑造人类基因组的军备竞赛

2014-09-30

  这场军备竞赛是在反转录转座子与其控制基因之间上演的。研究人员首次鉴定了控制反转录转座子的人类基因,这些基因编码的蛋白能够关闭这类转座子的活性。他们还追溯了这些抑制基因在灵长类动物中的快速演化。   转座子又称为“跳跃基因”,据估计跳跃基因大约占人类基因组的一半以上,而反转录转座子是其中最常见的一种类型。反转录转座子被认为是古代...

Illumina2014年将完成22.8万个人类基因组测序,预计2017年完成160万人

2014-09-29

Francis de Souza, president of illumina   一百年前,汽车大王亨利·福特降低了汽车的价格,让更多人能够拥有它。而如今,illumina公司也在做着这样的事情,不过,他们是让基因组测序更普及。近日,illumina的总裁Francis de Souza在出席EmTech世界新兴技术峰会时表示,今年全球的研究人员将完成228,0...

芝加哥GeneHub:全基因组测序服务定价3490美元欲向大众进行销售

2014-09-29

位于芝加哥的GeneHub公司计划成为第一个将全基因组测序服务直接销售给客户的公司。该公司称其已与多个使用Illumina HiSeq X 10测序系统的机构达成协商 ,并将每个基因组的测序价格定为3490美元。 如果GeneHub想要成功,它必须为普通客户提供最全的DNA数据,虽然目前Illumina在某些特殊事件中已经可以获得全基因组序列。(在一些纯粹主义的眼中,无论是...

子宫里的战争

2014-09-26

  有什么情景会比一位抚育婴儿的母亲更为动人?还能找到比这幅情景更能象征“爱、亲密和无限给予”的吗?圣母和圣婴会成为全世界最圣洁的宗教象征物,是有其道理的。   要见证这种母性慷慨之精神的极端案例,请想一想食母蛛(Diaea ergandros,蟹蛛科Thomisidae, 狩蛛属Diaea),这是澳大利亚蜘蛛的一个种类。一整个夏天...

北医三院:世界首例Malbac胚胎全基因组测序试管婴儿诞生

2014-09-24

   2014年9月19日,世界首例经MALBAC(multiple annealing and looping-based amplification cycles,是目前最先进的全基因组扩增技术)基因组扩增高通量测序进行单基因遗传病筛查的试管婴儿在北京大学第三医院诞生,这标志着我国胚胎植入前遗传诊断技术已处于世界领先水平。   婴儿的父母,男方为单基因显性遗传病患者...

个人基因组测序:高端体检走近寻常百姓

2014-09-22

  近年来,“基因检测”作为一个新兴名词却已经被大众所熟知,很多站在健康前沿的人尝试了适合自己的检测项目。   “基因检测运用分子生物学手段对人体易感基因进行检测和分析,从而对受检者的疾病风险高低进行评估预测,以便有针对性地开展疾病预防和健康指导。”21日,亚洲粉红丝带乳腺癌防治中心专家、成都蜀都乳腺医院副主任医师汪晓阳称,基因检测不同...

NIH向纽约相关高校投入120万美金 用于培养基因组学人才

2014-09-17

  美国国立卫生院向Buffalo 地区的高校投入120万美金,用于建立和完善学校的基因组学科建设,以鼓励更多的年轻人投身到生命科学领域。   Buffalo 大学会用这笔奖金SEPA去成立一个西纽约基因组研究中心,为周边的14所高校提供人才培养服务。   计划这笔SEPA奖金每年培训20名大学教师和500名在校大学生,持续5年...

诺禾致源:携手国家农科院解密大豆遗传多样性及重要基因

2014-09-16

  近期,中国农业科学院作物科学研究所与诺禾致源合作在野生作物资源研究方面取得重大突破,在国际上率先构建和分析了一年生野生大豆的泛基因组,为作物种质资源研究和利用提供了新的方法和启示。该研究成果于2014年9月14日发表在在国际著名学术期刊《自然-生物技术》(Nature Biotechnology)。   大豆是重要的油料和高蛋白粮饲...

解读完你的基因组,后果你曾想过么?

2014-09-16

  “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire,在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说,“尤其是对自己基因组信息的了解。”   虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年,但当被要求捐赠血液用作DNA测序时,她表示很纠结:“是时候要直面我的基因缺陷了,...

基因组学大牛谈long-read测序

2014-09-16

  网站近日发布了一个“Long Read测序的崛起(The Rise of Long Read Sequencing)”的系列访谈。主持人Theral Timpson就long-read测序采访了基因组学领域的一些大牛。   第一位受访者是斯坦福大学的Mike Snyder,他最近在《Nature Biotechnology》和...

NIH主任抱怨美国基因组研究已远落后于中国

2014-09-15

  数年前,柯林斯在华大基因称赞中国在基因测序领域取得的伟大成绩时,就暗自对美国在这一领域衰落感到忧虑。9月10日在一次众议院会上他大吐苦水,希望美国政府给予更多的资助从而来“赶超”中国。 数年前,现任美国国立卫生研究院(NIH)主任弗朗西斯·柯林斯(Francis Collins)在深圳华大基因的教室里一边颇有兴致地弹着吉他,一边与在坐的师生讲课,他大加赞赏华大基因在基因测序...

NIH:成立专项基金研究肠道菌群与脑部发育的关系

2014-09-14

  美国国立卫生院NIH出资100万美金,成立专项基金。用于研究人体肠道菌群结构与脑神经发育、神经健康、神经紊乱的关系。   NIH的这个项目是将人类微生物基因组计划产生的数据,用于分析人体肠道菌群是如何调节并影响大脑回流。将采用宏基因组测序技术和其他一些手段,对菌群结构进行分析和功能预测。   之前的研究表明,...

NEJM:基因组分析解析一种高危白血病亚型

2014-09-13

  最近,美国圣裘德儿童研究医院进行的一项多机构研究表明,在患有最常见急性淋巴细胞白血病(ALL)的年轻人当中,有超过四分之一的人为一种预后不良的高危亚型,这种白血病亚型的患者,可能从广泛用于其他成年人更常见白血病治疗的药物获益。相关研究结果发表在最近的《新英格兰医学杂志》(The New England Journal of Medicine)。 &e...

英国:10万人基因组计划能否颠覆医疗?

2014-09-13

       2012年,英国首相正式启动10万人基因组计划,该计划的目标是在2017年年底获得10万名癌症及罕见病患者的全基因组。目前已经完成了100个基因组。和过去遗传学中的“大科学”投资一样,10万基因组计划被期望能给临床医学带来变革。Genomics England公司(由英国皇家卫生部创建)表示,该计划将利用...

科学家发现长臂猿体内的某些基因有利于治疗癌症

2014-09-12

  据西班牙《世界报》9月10日报道,是什么让我们成为人类?这正是托马斯.马奎斯·博内特提出的问题,他带领一西班牙科学小组对长臂猿的基因组进行测序,并在本周三将研究结果发表在《自然》杂志上。几十年前人类就试图对这个问题进行回答,为此科学家们几乎分析了所有类型的灵长类动物的DNA,研究的最多的是与人类“亲缘关系”最近的无尾猴。   然而,...

基因测序有望用于辅助生育医疗 PGS助力试管婴儿成功率

2014-09-12

基因测序的应用,除了在我们熟知的无创产前检测方面获得应用;其另一重大应用——胚胎植入前遗传学筛查技术(Preimplantation Genetic Screening, PGS)将在辅助生育医疗领域应用。 9月5日,美国斯坦福大学生育和生殖医学中心与中国国内最大的试管婴儿连锁品牌爱维艾夫医疗集团在深圳签约战略合作协议,双方共同筹建中国国内最先进的PGS中心,试管婴...

最后一种猿类基因组被“破译”

2014-09-12

  一个国际科研小组10日说,他们已经完成了对生活在东南亚热带雨林中的长臂猿的基因组测序工作。至此,地球上所有猿类的遗传密码全部被“破译”。   长臂猿是一种小型类人猿,因其前臂长而得名,它的手腕关节灵活,能在树林中像荡秋千一样灵巧、快速地前进。猿类分为大猿和小猿,其中大猿包括黑猩猩、红毛猩猩、大猩猩和倭黑猩猩,它们的基因组均已测序完成...

克雷格•文特尔:没有商业价值的科学有何用

2014-09-11

1998年,克雷格•文特尔创建的营利性公司塞雷拉基因组公司(Celera)向人类基因组计划(由美国科学家于1985年率先提出,于1990年正式启动,旨在把人体内约4万个基因的密码全部解开,同时绘制出人类基因谱图——译者注)发出挑战,与政府打了个平手,在当时引起轰动,而后却被公司解雇。如今,这位生物学家运营着一家非营利组织文特尔研究所和两家生物科技公司。文特尔的一生充满传奇,手下...