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专家访谈
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干货！一文读懂液态活检研究进展及技术平台
液态活检（liquid biopsy） 液态活检这一概念最早在1974年由Sorrells等提出。液态活检主要检测对象包括：循环肿瘤细胞（CTC）、循环肿瘤DNA（ctDNA）以及肿瘤外泌体（exosome）等，它们来源于肿瘤组织，存在于血液，可以提示肿瘤发展进程及抗药性等信息，指导个体化精准治疗。与现有肿瘤检测方法相比，液态活检无侵入性、可频繁多次检测及快速...
透视单细胞DNA分析
人物简介： Gajus Worthington，美国Fluidigm公司创始人、CEO。 近年来， 他领导之下的Fluidigm公司将其独特的微流控芯片技术，开发了其包括C1、Biomark、Polaris等在内的单细胞分析产品线，在单细胞分析领域占有重要的一席之地。 Fluidigm公司很早就开始专注单细胞分析这...
创新ctDNA高通量测序技术让临床不再“盲人摸象”
安可济（AccuraGen）公司联合创始人兼科研总监赵奇志（Grace Zhao）博士 在3月6日-11日举行的旧金山分子医学三方会议（The Molecular Medicine Tri-Conference）上，安可济（AccuraGen）公司的联合创始人兼科研总监赵奇志（Grace Zhao）博士首次发表了安可济独创的...
Nature：用二维码构建“DNA编码库”，DNA标签成药物研发支柱
麻省沃尔瑟姆市（Waltham, Massachusetts）的一座钢筋混泥土建筑的二楼，一个实验室冰箱里的塑料盒中，包含着无数种化学分子。这些分子是葛兰素史克制药公司（Glaxo Smith Kline，GSK）合成的带DNA标签的分子，数目达到万亿种——这是银河系恒星数目的10倍。 各大制药公司和生物工程公司都在采用这种DNA编码分子库来迅速筛选能与疾病相关蛋...
23andMe公司计划使用iPhone与研究人员共享DNA数据
遗传学公司23andMe计划让客户使用他们的iPhone手机与研究人员分享他们的基因数据以开展医学研究。 该计划将允许大学研究人员能够通过谷歌公司访问收集的DNA图谱，并把他们与目前正在从参与者手机收集的健康相关数据进行配对。 据知情人士透露，此次合作预计会在苹果公司位于加州库部蒂诺总部举行的新品发布会上公布，合作者包括斯坦福大学、纽约的the Icahn S...
10x Genomics 宣布C轮5500万美元融资 发展长DNA读长技术
10x Genomics这个名字来源是希望在竞争者中显得更为突出，而不是企图硬碰硬。这种做法似乎得到了回报。最近，该公司迎来了5500万美金的C轮融资，这部分资金用来进行长读长测序技术开发。 10X Genomics' product--Courtesy of 10X Genomics Fidelity Management ...
循环DNA也能诊断糖尿病和脑损伤
循环DNA分析已经成为胎儿基因诊断的工具，也被作为癌症诊断的重要手段，目前有学者开始用这种血液分子特征进行更多疾病诊断的策略。在人的整个生命过程中，细胞随时发生死亡，死亡的细胞发生破裂，染色体内DNA断裂成大量片段扩散入血液，随着血液在全身循环。即使十分健康，每个人身体内总有大量细胞死亡。当疾病和组织损伤发生时，特定器官组织细胞发生更多损伤，这种特定的循...
盘点趣味科学知识：母亲产后仍会保留胎儿DNA
西班牙《万象》月刊11月号发表题为《科学知识小问答》的文章，对一些有趣的问题进行了解答。文章内容如下： 1.什么年龄丧失学习新词的能力？ 最新研究表明，人到60岁左右开始丧失学习新词的能力。但是与开始丧失记住陌生人的长相（20岁左右）和通过眼神来解读对方情绪的能力（40岁左右）等其他技能的时间相比，这已...
ctDNA液体活检技术与行业分析
在“2020年全球液体活检市场将达220亿美元”（BCC Research）的喧嚣声中，数家公司和科研机构正着手将循环瘤DNA（ctDNA）测试引入液体活检并将之推向市场。 去年9月，Pathway Genomics以299到699美元的定价将其循环瘤DNA测试CancerIntercept Detect投放市场，引起美国FDA的严重不满。9月21日，Pathway创...
液态活检的“当家花旦”：cfDNA和CTC
液态活检（liquid biopsy）已经成为临床肿瘤学的一门“显学”，其学术意义和临床应用前景也越来越明朗。液态活检按照检测对象分类，主要可以分为核酸层面的ctDNA和细胞层面的循环肿瘤细胞（CTC）。 胰腺导管腺癌（pancreatic ductal adenocarcinoma, PDAC）是一种恶性肿瘤，患者被确诊时往往已处于晚期，甚至病灶已经转移。临床上可通过手...
DNA应用商店开张，约吗？
如果你喝凉水都长肉，那就把自己的唾液寄给某家基因测序公司，然后打开手机下载App，花上几美元就可以查到自己是否携带肥胖基因，如果携带，那就请放弃减肥吧。 近日，药明康德发布了首款个性化健康管理服务产品——康码，用户只须提供2ml唾液，即能通过当前最先进的全基因组测序及其解读，获得一份权威的健康报告，并通过配套的App全面了解...
Science：垃圾DNA的大作用
大约8%的人类DNA起源于病毒：是我们的祖先与传染性病毒之间古老斗争的残留物。这些所谓的内源性病毒常常被认为是没有明确生物学意义的垃圾DNA。但来自美国犹他大学医学院的科学家们在一项新研究中证实，进化改变其中一些病毒残余物的用途，使之成为了对付病毒自身的武器。 在发表于3月4日《科学》（Science）杂志上的论文中，科学家们报...
Illumina DNA测序界的谷歌
可以说，Illumina在DNA测序界的地位，就像谷歌在互联网搜索界的一样，或许这么说还低估了这家位于圣地亚哥的生物科技公司。Illumina的机器，是市场上最好最便宜的，产生了当今所有DNA序列数据的90%。正如人们所说，Illumina简直就是，基因霸主。 但，即使Illumina如今那90%的蛋糕如此有利可图，在未来，整块...
DNA App Store:一次测序、收益一生
一天，Kao正在一边开车一边听着美国全国公共广播电台，当他偶然听到能让人们嗜甜如命的“甜食基因”被发现的同时，“Oh my God,”对甜点爱不释手的Kao心理想到“我一定要花5美元看看我是不是有这个基因。” 同样，作为去年夏天在旧金山成立的Helix 联合创始人之一，Kao也希望别人能为他们基因所反映的这些小花絮而花上...
Science及Nature共述：口袋里的DNA测序仪，可实现实时诊断
纳米孔测序的想法起始于25年前， 2012年5月4日《Science》首次报道了Oxford Nanopore公司研制的纳米孔测序仪样机——MinION，用于破译病毒DNA。然而MinION的发展历程并不那么顺利，英国牛津大学基因组学中心基因组学家Rory Bowden说，“众所周知，在每次读取的水平上，MinION不是很精确”。2014年2月《Scie...
CRISPR应用指南：导入DNA、RNA还是蛋白质？
在基因组编辑的世界里，CRISPR/Cas9代表着王牌。它为研究人员带来了一种简单的方法，将核酸酶、转录调控因子或荧光蛋白送到基因组中的任何地址。这种方法已改变了疾病研究、基因调控、药物开发等。 不过，研究人员首先需要将Cas9蛋白和向导RNA（gRNA）导入他们感兴趣的细胞。事实证明，他们有几种选择。 &emsp...
长链非编码RNA+DNA甲基化=癌症生长调控
DNA甲基化是基因活性的一种关键调节器，在癌细胞中，错误的甲基化修饰会导致肿瘤的过度生长与功能障碍。而且抑癌基因位点上也常常会甲基化增多，导致抑癌基因功能活性关闭，而基因组其它部位则会出现甲基化减少，这也许是为了能释放更多的空间。 “没有人明白是什么驱动了癌细胞过度甲基化，”来自俄亥俄州凯斯西储大学的遗传学家Ahmad Khal...
【硬菜】基因检测行业调研
继上次基因检测产业调研之后，这两周我们再次调研了几家基因检测公司，并且拜访了一些行业专家，现将调研的重点内容整理如下，欢迎大家交流探讨。 一、基因检测公司梳理 目前全国涉及基因检测概念的公司有200余家，按照业务范围划分，这些公司可以分为：①最上游的基因检测仪器开发企业（测序仪、芯片扫描仪、PCR设备），②...
基因编辑技术先驱Doudna亲述：伦理问题让我彻夜难眠
基因编辑带来的社会争议越来越大 大约20个月前，我开始出现睡眠问题。这距离我和我的同事发表细菌的CRISPR–Cas9系统可以用于基因工程这篇文章差不多有两年时间。 我惊愕于世界范围内的实验室如此快速地将这一技术应用于生物学的各个领域，从改造植物到改变蝴蝶翅膀的花纹，再到构建人类疾病的大鼠模型。与此同时，我却忽略了对这一被广泛采用的基因改造技术在...
“垃圾DNA”或是编码DNA的“卫士”
“垃圾DNA”的概念是在上世纪70年代提出来的，用来形容那些基因组中不是编码蛋白质的DNA序列，而在学术上被称为非编码DNA序列。 由于当时的科学家普遍认为有生物学意义的蛋白质才是决定生物性状的关键，而且也没有一种好的理论和技术手段来解释这些“垃圾”存在的原因，于是“垃圾DNA”这一观念便形成并且逐渐根深蒂固，也一直影响着人们对于基因...