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专家访谈
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Cell Rep:美学者介绍DNA序列对肿瘤新作用
2016年11月1日， 国际著名学术杂志《Cell》子刊《Cell Reports》杂志在线发表了美国北卡罗来那大学Ian J. Davis研究员的一篇研究论文，研究报道某些短的DNA重复序列，或“垃圾DNA”，在尤文肉瘤的发展中起着重要的作用，这是一种罕见的骨与软组织肿瘤，在儿童和青少年中最常见。 Ian J. Davis博士说：“有些人可能仍然认为这些非编码序列是垃圾序列;它...
真实体验五家基因测试公司，DNA数据库错误信息可能给精准医疗带来噩梦！
当你参与基因测试后，如何获取有价值的数据，遗传基因分析与某些特定的功能到底有何联系？美国知名记者 REBECCA ROBBINS体验了DNAFit, Genomic Express, Kinetic Diagnostics, Orig3n, 以及Simplified Genetics五家公司的基因测试服务，价格从154美元到400美元，帮助我们对于这个行业有一个初步的了解。 我...
DNA修复：解密癌细胞的端粒延长机制
染色体末端，即端粒不断变短限制了细胞的寿命。一些癌症细胞通过一种名为端粒替代延长的机制来避免这一命运，但这一机制的具体分子细节还有待进一步探究。 细胞分裂期间，基因组的复制由DNA聚合酶实现。然而，每个染色体的末端是不完全复制的，这是因为DNA聚合酶需要5端'RNA引物，才能进行合成。这意味着DNA末端的重复序列——端粒在每次分裂时都会缩短。这种缩短限...
癌细胞“劫持”DNA修复途径来扩散
最近，美国匹兹堡大学癌症研究所（UPCI）的科学家发现，癌细胞能够“劫持”DNA修复途径来防止端粒（染色体的端帽）缩短，从而使肿瘤细胞扩散。相关研究结果发表在11月8日的《Cell Reports》杂志上。 在一个细胞形成的时候，有一个倒计时钟开始滴答作响，决定了细胞能活多久。这个时钟就是端粒，是在细胞内每一条染色体末端的一系列重复的DNA字母。 然而，癌症细胞巧妙地“劫持”了这一端粒...
培训 | 二代测序在DNA及RNA表观遗传研究中的应用
甲基化是表观遗传学的研究重点，也是复杂转录调控系统中的重要组成部分。在真核生物中，甲基化在正常的细胞发育和维持组织稳定性方面有着重要作用。同时，甲基化还与基因组印记、X染色体失活及肿瘤发生等多种生物学过程相关。 羟甲基化和m6A甲基化是目前表观研究的热点。 hMeDIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术，利用该技术可有效地寻找基因组上的甲基化区域，从而比较不同细...
Cell：科学家发现DNA修复的关键酶
日前，一项刊登在国际杂志Cell上的研究报告中，来自澳大利亚国立大学和德国海德堡大学的研究人员通过研究发现了一种DNA修复过程中的必要组分，该研究或为后期开发新型抗癌药物提供一定的思路。 研究者Tamas Fischer教授指出，当DNA被损伤后，由DNA和RNA组成的混合结构在修复遗传信息上扮演着重要角色，RNAs是一种储存在DNA中短暂的遗传信息副本；文章中，研究...
Nature遗传学：生孩子由DNA决定？
什么时候生孩子、生几个孩子，这些问题似乎纯粹是个人选择。牛津大学和格罗宁根大学的研究人员首次揭示了这些生殖行为的生物学基础。他们十月三十一日在Nature Genetics杂志发表文章指出，人类生殖行为与12个DNA区域密切相关。 研究人员对62个数据集进行了深入研究，分析了238,064名男女首次生育的年龄，以及330,000名男女的子女数量。他们在此基础上分离了与人类生殖行为有关的一些遗...
你的DNA让你患上癌症吗？
乍一看，你可能不会认为我和好莱坞一线明星安吉莉娜朱莉有什么共同之处。但你错了。我们都携带BRCA基因突变，这使我们很有可能患上与我们的母亲和外祖母相同的癌症。 “我的母亲，外祖母和姨祖母都在40多岁的时候被诊出患有乳腺癌。我的母亲在59岁时死于胰腺癌。”安吉丽娜朱莉家族中至少八名成员被诊断为患有癌症，而且可能与BRCA1基因突变有关，其中包括她的母亲、祖母和阿姨。 但这种预防性手术...
发现隐藏在DNA折叠中的精神分裂症秘密
精神分裂症是一种众所周知的难以理解和治疗的疾病。使用3-D染色体作图的新研究帮助科学家获得关于这种破坏性疾病背后的遗传机制的新见识。 精神分裂症是一种以妄想，幻觉和其他显着认知困难为特征的致残性疾病。 影响全世界近1％的人口，估计有超过5000万人患有精神分裂症。 由于精神分裂症的具体原因并不是很清楚，所以目前的药物治疗只是帮助减轻症状，但不能治愈疾病。 ...
PLOS ONE：二手烟如何致癌？这次与DNA修复有关
近期，肯塔基大学的研究人员指明了烟草烟雾促进肺癌发展的一个新途径：抑制一种名为核苷酸切除修复（NER）的DNA修复过程，相关结果发表在《PLOS ONE》杂志上。 烟草烟雾中的许多成分都是致癌物，可以破坏DNA，这种损失必须通过DNA修复机制来清除以防止基因突变的发展，因而DNA修复过程如NER是阻断DNA突变累积的关键，而DNA突变累积也是推动肺...
DNA“跨界”：DNA支架能自组装成单电子器件 无需低温环境
据美国电气和电子工程师协会《光谱》杂志官网近日报道，芬兰科研人员研究发现，DNA（脱氧核糖核酸）支架无需低温环境，就能够自组装成固定模型，并将纳米颗粒融合到功能性结构中，集成单电子器件。相关成果发表在近期《纳米通讯》杂志上。DNA支架技术是纳米生物学的重要组成部分。DNA分子除具有基因的遗传特性外，还是一个结构精巧的一维纳米线。将DNA与纳米材料组合起来，可为生命科学、材料科学、环境科学等领域带来...
如何让DNA测序的成本更低？PNAS又出新招
在个性化医学中，医生可以快速收集到患者DNA序列中的变化，并确定最合适的治疗方案。然而，当前利用下一代测序技术来阅读DNA序列所需的成本仍很昂贵，并且需要具备精良的仪器设备。如今，哈佛大学Wyss研究所的Church研究团队开发出了一种基于生物工程纳米的新型电子DNA测序平台，该平台可以克服二代测序技术的一些缺点。相关结果于近日发表在PNAS杂志上。 Wyss研究所的核心成员、哈佛...
首次发现细菌病毒携带动物DNA
科学家发现，侵入细菌的一种病毒中潜伏着很多能表达出毒性蛋白的基因。这些基因本非病毒基因组的基因，而是来自于黑寡妇毒液基因以及其他一些动物的DNA。研究者们认为，要么是病毒偷窃了其他生物的基因，要么是其他生物的DNA入侵了病毒基因组。 病毒是一种充满争议的生物。他们几乎可以入侵感染三界（动物、植物和微生物）的所有生物，然而大多数的病毒都仅有简单的结构...
Nature：DNA重复序列是否致病取决于什么？
DNA重复序列在人类基因组中是很常见的。重复序列已经被提出作为一种进化机制，但是它们可能与人类疾病相关。现在，马克斯-普朗克分子遗传学研究所和Charité – Universit?tsmedizin Berlin的科学家已经证明，DNA重复序列是否与人类疾病相关，取决于它们在基因组中的位置，序列重复可能导致形成新的功能单位——称为拓扑关联域（TADs）。在《Nature》...
无细胞DNA测序确证骨髓增生异常综合征的诊断
使用下一代测序（NGS）法，分析骨髓增生异常综合征（MDS）患者血液中的无细胞DNA（cf-DNA），获得比现有Sanger测序法更准确的结果。 骨髓增生异常综合征（MDS）是一组由多种疾病组成的综合征，以骨髓中出现克隆肿瘤细胞为特征，后者能导致无效造血和外周血（PB）白细胞减少。诊断MDS的主要标准是出现外周白细胞减少和非典型增生。 总DNA提取用NucliSENS ...
研究人员发现DNA碱基编辑的新方法
10月10日，国际学术期刊《自然-方法》（Nature Methods）在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diversification in mammalian cells 的最新研究成果，报道了利用靶向性胞嘧啶脱...
ctDNA检测放大招：新方法监测敏感度是过去的2倍
近期一项研究显示，一种新型的化验方法可检测结直肠癌患者血液中的肿瘤DNA，发现肿瘤复发的早期征象，其检出率是现有标准方法的两倍。 该检测方法发现，将近70%的复发病人血液DNA中存在甲基化的BCAT1和IKZF1基因。而目前用于结直肠癌术后病人肿瘤复发监测的癌胚抗原(carcinoembryonic antigens, CEA)试验，阳性率只有32.1%。 该项研究的共同作者之一，...
干预DNA太危险 RNA或许蕴含让人长生不老的秘密
据英国每日邮报报道，在传统的生物观念中，细胞中的RNA一直是从属于DNA的次要角色。不过最近一项研究表明，RNA中或许蕴含着可使人长生不老的秘密。相比DNA，对RNA进行干预，不仅更安全，而且效果也会更显著。 衰老和癌变是医学界的两座大山。随着人们年老力衰，DNA健全程度也每况愈下，最终无法正常地扮演自己的角色，导致各种疾病和癌变。 伊莉莎·拉扎里（Elisa L...
胎儿游离DNA的时代可能结束了
贝勒医学院、德雷克赛尔大学医学院、德克萨斯儿童医院以及RareCyte公司的研究人员近日在《Prenatal Diagnosis》杂志表明，基于母体血液中罕见胎儿细胞的无创产前基因检测是可行的，他们估计，这种方法将在未来1至2年内向公众开放。 本文资深作者Arthur Beaudet博士说，“孕妇循环血液中的罕见胎儿细胞首次被报道大概在40年前，从那时起人们就一直希望能...
【2016CSCO】慧渡医疗：世界首次推出“ctRNA+ctDNA”的联合检测 技术-“基因雷达”
从左至右：贾士东博士、尚鸣异博士、Winston Patrick Kuo博士 慧渡医疗的卫星会正好在午餐结束时开始，为此，慧渡医疗也亲切地为所有与会来宾提供了精美的午餐。十二点三十六分，慧渡医疗卫星会正式开始。CSCO组委会明智地为慧渡医疗选择了最大的会场，即便如此，慧渡医疗卫星会的600个座位依然座无虚席。 贾士东博士 大...