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专家访谈
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“富矿”的开发——浅谈miRNA的研究
什么是microRNA？ microRNA(microRNA)是一种小的内源性非编码RNA分子，大约由21-25个核苷酸组成。通过与靶基因的3’UTR配对，促进mRNA的降解或抑制mRNA的翻译，从而抑制靶基因的表达。 现在，miRBase（1）共收录223个物种的28645个microRNA前体...
展望NGS的下一个突破点，RNA-Seq和线粒体测序上榜
如今NGS已能够快速经济地阅读数亿个reads，所及之处远超越基因组学（如RNA测序使转录组学发生革命性变化）。尽管NGS取得了诸多进步，但依然存在一些重大的挑战。日前，牛津大学举办的“NGS七周年大会”聚焦了NGS面临的挑战，此次会议阐述了NGS领域最令人生畏的障碍，同时也阐述了跨越这些障碍的技术。 本次会议中提及的NGS...
PNAS：用RNA干扰来治疗恶性肿瘤
套细胞淋巴瘤（MCL）被认为是最具侵袭性的血癌，中位生存时间仅为七年，目前可用的治疗方法很少。每年有三千美国人被诊断为MCL，尽管用于身体其他部位转移瘤的个性化疗法已经取得了一定进展，但是，系统性的将治疗药物传递到癌细胞，对世界癌症研究来说仍然是个挑战。 最近，以色列特拉维夫大学（TAU）的一项新研究，为治疗目前无法治愈的血癌等...
两篇Science：父亲饮食会通过精子RNA影响后代
近年来人们逐渐意识到，男性能通过多种途径对自己的后代产生影响，比如精子表观基因组、微生物组转移和精液信号传导。Science杂志十二月三十一日发表了两项引人注目的小鼠研究。研究表明，父亲的饮食会改变精子的RNA，进而影响后代的基因调控。 在第一项研究中，中国科学院的科学家们将雄性小鼠分为高脂饮食和低脂饮食两组。他们发现，高脂饮食...
最新RNA分子诊断技术有望用于诊断老年痴呆症
Affymetrix与XRGenomics LTD合作开发年龄相关疾病的新一代RNA分子诊断检测。 2015年11月5日，来自加州圣克拉拉的消息 —— Affymetrix公司（纳斯达克代码：AFFX）和XRGenomics LTD宣布，他们将合作研究与开发年龄相关疾病的新一代诊断检测，XRGenomics LTD是一家英国的生物技术公司。目前超过50%的医疗费用花在...
Nature子刊惊人发现：抑癌的snoRNA分子
根据斯坦福大学医学院的研究人员所说，一对原以为只是充当细胞管家的RNA分子，在超过四分之一的常见人类癌症中缺失。肿瘤中丧失这些RNA分子的乳腺癌患者相比于其他的乳腺癌患者生存率要低。 研究人员发现，这些RNA分子直接结合并抑制了一个众所周知的癌症相关蛋白KRAS。在缺失这些分子的情况下，KRAS会过度活化，向细胞持续发送信号促进细胞分裂。 斯坦福大学医学院皮肤病学系...
天津医科大：肿瘤转移相关的lncRNA
晚期口腔鳞状细胞癌（OSCC）患者的预后仍不乐观，更好地了解其背后的机制，对于确定有效的治疗靶标，提高OSCC患者的生存率，是至关重要的。最近，来自天津医科大学和美国达茅斯Geisel医学院的研究人员，在Nature子刊《Scientific Reports》发表题为“Long Non Coding RNA MALAT1 Promotes Tumor Growth and Me...
揭示肿瘤诊断新方法，基于血小板的RNA测序
近日，来自阿姆斯特丹自由大学的Myron G在《Cancer cell》发表的一篇文章提出，基于肿瘤血小板（Tumor-educated blood platelets，TEPs）的RNA测序可用于泛癌症分析、癌症类型的区分和肿瘤基因突变诊断。 结果表明，血小板的RNA测序可以区分癌症患者与健康人，其准确率达到96%，也能区分六种原发肿瘤类型，其准确度达到71%，并能识...
曹雪涛院士权威期刊连发miRNA、癌症新文章
曹雪涛（Xuetao Cao）院士是国际著名的免疫学家。其现任职浙江大学医学院、中国医学科学院、第二军医大学，主要从事肿瘤免疫治疗和分子免疫学方面的研究，曾在树突状细胞的免疫学和肿瘤的免疫与基因治疗研究方面获得重要成果，以通讯作者的身份在Nature Immunology、Nature Communications、Immunity等国内外知名杂志发表论文200多篇。2013年...
Cell Stem Cell：RNA甲基化与干细胞命运
西奈山伊坎医学院的研究人员鉴定了一种控制干细胞性能的关键蛋白，可以提高它们在再生医学中的实用性。这项研究发表在十月二十九日的Cell Stem Cell杂志上。 将干细胞用于临床治疗，需要严格控制其多能性（分化为其他细胞类型的能力）和自我更新（持续分裂和增值的能力）。研究人员发现，锌指蛋白217（ZFP217）控制着干细胞自我更新和分化之间的平衡。 “ZPF217可...
环状RNA研究培训班华东站—晶能生物为您科研添能量！
环状RNA测序是新兴的转录组测序技术。过去普遍认为细胞内的非编码RNA多以线型存在，近年来越来越多的研究发现，环状RNA在哺乳动物细胞内的表达量远高于普遍认识水平。环状RNA可以参与基因的表达调控，例如封闭miRNA的作用、调节本位基因的表达等，是非编码RNA研究中的一个新的研究热点。 晶能生物作为国内高通量测序的先行者，一直...
RNA编辑技术治疗严重罕见病
肌肉萎缩症目前还没有治愈的方法，患有这种疾病的儿童在早年失去了重要的肌肉力量。根据来自美国西北大学医学院和芝加哥大学的一项最新研究，一种被称为“外显子跳跃（exon skipping）”的RNA编辑技术，在治疗一种罕见而严重形式的肌肉萎缩症的过程中，已经取得初步成效。相关研究结果发表在十月十二日的《Journal of Clinical Investi...
华人学者Cancer Cell：首张人类癌症非编码RNA综合图谱
随着对重要但知之甚少的基因组部分——“DNA暗物质”的认识日渐增加，从根本上改变了科学家们研究疾病的方式。人类基因组中包含有大约2万个蛋白质编码基因（占总数的不到2%），而70%的基因组被转录为非编码RNA（延伸阅读：Cell惊人发现：谁说非编码RNA不编码？ ）。但当前仍尚未系统地调查过这些称作为长链非编码RNAs (lncRNAs)的片段以及它们发...
单细胞RNA-seq发现调节干细胞发育的新基因
最近，Wellcome Genome Campus的一项新研究演示了单细胞基因组学的力量，揭示了它如何能帮助科学家了解细胞的早期发育。这项研究发现了参与干细胞调控网络的新基因，以及新的细胞亚群，可让我们深入了解干细胞多能性——成为几乎所有不同类型细胞的能力。研究人员还为干细胞群落开发了新的资源，这将有助于解释未来的调查。相关研究结果发表在最近的《Cell Stem Cell...
Science公布单个循环肿瘤细胞RNA测序结果
由麻省总医院，哈佛大学主持的一项最新研究发现了前列腺癌细胞对一种常见的癌症治疗方法产生抗性的原因，研究人员完成了前列腺癌单个循环肿瘤细胞的RNA测序，其中找到了非经典Wnt信号所起的关键作用。 这一研究成果公布在9月18日的Science杂志上。 Androgendeprivationtherapy，也就是雄激素剥夺疗法（ADT，也称为去势治疗）主...
DNA芯片技术和RNA测序，有啥不一样？
日本推理小说家东野圭吾的作品《白金数据》中描述了这样一个未来世界：日本政府秘密建立名为“白金数据”的数据库。该库搜集了全国人民的DNA数据，通过对犯罪分子留在现场的毛发、体液等证物进行比对，警方可以高效、快速、准确锁定真凶。借助“白金数据”的帮助，一个检举率100%、冤案率0%的理想法制社会构建完成。技术的发展可以改变人类的生活，小说的情节虽然是虚构的，但随着技术的不断发展和进...
为CRISPR设计高效sgRNA的新方法
CRISPR-Cas9技术，为基因组工程提供了一个强大的系统。然而，不同单导向RNAs（sgRNAs）之间的可变活性，仍然是一个重要的限制。八月三十一日在Nature子刊《Nature Methods》发表的一项研究中，来自耶鲁大学医学院的研究人员，分析了影响体内sgRNA稳定性、活性和装载的分子特征。 基因组编辑系统，对于利用...
Cell重要发现：RNA命运由谁定？
由DNA转录过来后，RNA可继续走向多种命运。虽然最为人熟悉的道路是直接促成了蛋白质的生成，RNA分子自身也能够改变基因的表达。新研究帮助解释了实现RNA序列命运的机制。 在发表于8月27日《细胞》（Cell）杂志上的一项研究中，洛克菲勒大学的科学家与哥伦比亚大学的同事证实一种蛋白质识别了附着在RNA序列上的化学指令标记——这是...
中山大学JBC解析抑癌miRNA
AKT信号在星形细胞瘤的进展过程中，起着重要的作用，但是AKT组成性激活的根本分子机制，仍然没有得以阐释。越来越多的研究报道称，microRNAs通过直接靶定多个致癌基因或肿瘤抑制基因，参与星形细胞瘤的恶性行为。最近，来自中山大学的研究人员在国际学术期刊《Journal of Biological Chemistry》发表一项研究表明，miR-542-3p在星形细胞瘤进展...
干细胞先驱：助力单细胞RNA-seq的统计法
以精确的定时模式表达的基因，被称为振荡基因，在细胞分裂、昼夜节律和肢体形成这样的发育功能中，起着重要的作用。但是，因为我们不能对基因表达进行定时的观察，因此，这些基因在很大程度上是未被发现的。 最近，美国Morgridge研究所和威斯康星-麦迪逊大学的科学家们开发出一种算法，提供了一种新的方法，来识别振荡基因的动力学，并首次确定了这些早期发育力量的作用。 ...