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专家访谈
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有个mRNA，觉得自己很孤单。
有个mRNA，觉得自己很孤单，就拉个核糖体过来翻译个蛋白给自己作伴，翻译好之后对蛋白说：“你好，我是你的模板。”蛋白说：“你好，我是 RNase。” mRNA沉默了一下，说：“没关系，反正我本来也活不了多久。你就陪陪我吧。” 蛋白说：“好”。 于是两个人（？）就手拉手默默地站在一起。 过了一会儿蛋白忽然说：“其实我现在还不是R...
西兰花防癌分子机制揭示，lncRNA成癌症治疗新“法门”！
近日，一批来自美国俄勒冈州立大学的科学家通过实验发现并验证了西兰花等日常食用蔬菜造诣于人类健康乃至预防癌症的内在分子机制。 研究人员发现一种来自西兰花等蔬菜的化合物萝卜硫素（sulforaphane）可能会在一定程度上作用于细胞内长链非编码RNA（lncRNA），进而对前列腺癌等癌症起到预防作用。该研究对应的文章发表于最新的营养生物学杂志（Journal of ...
Nature:中心法则的“补充”，lncRNA与疾病或具潜在联系
长久以来，学术界已知认为特定基因通过转录产生mRNA并继续翻译产生蛋白质以对细胞活动乃至机体性状进行调节与控制。然而，伟大的中心法则事实上并不能涵盖和解释所有的生命现象，最近几年，越来越多的研究阐述着中心法则之外的基因故事。科学家发现即便不通过转录与翻译，某些特殊的DNA片段也能够通过独特的方式对疾病的发生产生影响。 日本理化学研究所（RIKEN，RIkagaku KENkyush...
《Journal of Clinical Oncology》报道可预测早期肝癌术后复发可的甲基化标记物
研究背景 在全世界分范围内，每年因肝癌死亡的病例超过50万人，是主要的致死恶性肿瘤之一。在过去的十年中，随着影像学的进步以及健康体检的普及，越来越多的肝癌病人在患病早期被发现。但由于肝脏捐赠者的短缺，外科肝脏切除术仍然是治疗早期肝癌病人的最主要方法。目前对于术后患者缺乏准确预测体系或标志物。本研究建立了一种预测早期肝癌病人术后复发的模型。 研究结果 1. ...
甲基化与lncRNA: 表观遗传学与转录组学研究的完美结合
2017年国自然申请的热点什么？circRNA，lncRNA，外泌体。除了这些大家耳熟能详的香馍馍之外，现在很多小伙伴们开始了新的玩法，通过多平台联用，将不同层面的东西结合起来，比如，表观遗传与非编码RNA的结合，就是一个很好的例证。 研究背景 肺癌是一种常见的恶性肿瘤，特别在中国，由于环境的污染，肺癌的发生率也在持续升高。非小细胞肺癌（NSCLC）是肺癌中最常见的...
Science最新成果：一种能让细胞“变身”的miRNA
在被无情剥夺这种miRNA之后，你一定不会相信干细胞竟然会发生这种改变，一项最新研究表明，通过去除单个微小RNA（miRNA），多能干细胞竟可以实现罕见的全能化，获得分化成为胎盘等胚外组织的能力。这一研究极大程度上丰富了学术界对于细胞发育调控分子途径的认识，可以帮助临床医生和科学家通过干细胞技术生产更多现有技术所力不能及的组织成分，对再生医学和基于干细胞的临床疗法开发具有重要意义。 ...
Science:魔剪CRISPR，助力非编码RNA不再“沉默”！
人和动物的细胞内存在着很多种不同的长链非编码RNA（lncRNA），这些lncRNA在基因的表达调控与多种细胞功能行使过程中扮演着极其重要的角色。然而，由于技术与研究方法的限制，目前学术界对lncRNA的认识仍然可谓冰山一隅，lncRNA领域的大量宝藏亟待科学家开发新的技术手段来进行深入挖掘。 近日，一篇刊登于顶尖杂志Science的文章报道了一种新型的高通量...
microRNA调节眼睛干细胞功能的分子机制
近日，来自美国西北大学的研究人员通过研究发现，microRNA-103/107家族（miRs-103/107）能够调节富含干细胞的眼睛角膜缘上皮组织的生物学过程，相关研究刊登于国际杂志the Journal of Cell Biology上。 这项研究首次阐明了细胞自噬过程和巨胞饮（Macropinocytosis）之间的关联，细胞能够进行自噬过程，以这种方式作为降解细胞内废物和对压力产生反...
Nature：揭示lncRNA在调节细胞过程中发挥重要功能
lncRNA似乎是以类似于编码蛋白的mRNA那样由我们的DNA通过转录而产生的，但是不能够翻译为蛋白。尽管lncRNA分子并不产生相应的较长的蛋白，但是研究人员想知道这些lncRNA分子中的一些是否可能含有能够编码非常短的蛋白或者说多肽的序列片段。 论文通信作者、美国贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）癌症研究所主任Pier Paolo Pandolfi博士说，“这些小分子的...
时隔一年 华人教授再次发表Nature文章解析RNA病毒
去年，来自加州大学洛杉矶分校（UCLA）加州纳米技术研究院的周正洪教授与其合作者在Nature杂志上发文，揭示了双链RNA（dsRNA）病毒的三维原子结构，首次指出了病毒如何感知宿主细胞内的环境条件以触发转录，并阐述了dsRNA基因组在病毒内如何组构以及RNA自我复制的机制。 时隔一年，周正洪教授与孙仁（Ren Sun）再次发表题为“In situ structure...
伯豪客户发表干燥综合征相关的lncRNA表达模式研究成果
研究背景 原发性干燥综合征（pSS）是一种由于外分泌腺紊乱引起的自身免疫性疾病，最典型的临床表现为口眼由于唾液腺和泪腺原因而导致的异常干燥。LncRNA是目前转录组学研究的热点，但是，lncRNA是否与pSS的发病有关，目前还没有相关报道，来自上海第九人民医院的研究人员，通过唾液腺中lncRNA的表达模式研究，阐述了lncRNA在干燥综合征中的作用。 研究结果 1. pS...
CRISPR-RNAseq:把混乱的基因编辑结果屡清楚
对复杂基因网络的分析可以简单概括为三步：1.向大量细胞引入CRISPR基因编辑系统。2.应用单细胞RNA测序分析这些基因编辑的影响。3.分析基因型和表型之间相互作用的遗传途径。通过遵循这些步骤，研究人员可以比以前更有效地探索基因组遗传风险因子的功能影响，观察和研究癌细胞中发生突变的具体基因。 通过CRISPR基因编辑系统与单细胞RNA测序的结合，加州大学旧金山分校（UCSF）和Br...
microRNA的又一新角色：或将用于治疗脑癌
约翰霍普金斯癌症研究中心最新发表的两个研究揭示脑组织癌细胞与正常组织细胞的基因表达存在差异，ATRX基因和miR- 487 b的缺失或突变将会导致脑神经胶质瘤的发生，提示这或许能为脑神经胶质瘤患者提供新的潜在治疗靶标。 其中一个发表在《Acta Neuropathologica》杂志上的文章显示，研究人员通过对27名Ⅰ型脑神经胶质瘤的患者进行...
Nature：首次发现RNA剪接与衰老之间存在因果关系
衰老是各种破坏性慢性疾病的一个重要危险因素，但是，随着时间推移生物学因素如何影响“细胞何时以及多快的衰老”，在很大程度上仍然是未知的。现在，由哈佛大学T.H. Chan公共卫生学院带领的一个研究小组，将细胞机器——其在一个称为“RNA剪接”的过程中切割和重新连接RNA分子——的一个核心部件的功能，与线虫长寿联系在一起。这一发现揭示了剪接在生命周期中的生物学作用，并表明，操...
lncRNA通过调控CD56参与自然杀伤细胞发育过程
自然杀伤（NK）细胞是一类先天性免疫淋巴细胞，与体外病毒感染和免疫调节有关。但是，lncRNA在NK细胞生物学过程中的作用还不是很清楚。研究人员借助于高通量lncRNA芯片检测技术，分析了NK细胞中lncRNA表达模式，发现了调控NK细胞分化和生物学功能相关的lncRNAs。其中，lnc-CD56，作为正调控因子，与CD56的表达呈正相关模式，参与了初级NK细胞的分化过程。该研究证实l...
循环MicroRNA：下一代肿瘤生物标志物
对于不同癌症患者，已有研究发现其血液循环中的游离核酸存在肿瘤特异或相关改变。微小RNA（miRNA）是一类转录后调节基因的短非编码RNA，其在发育和正常生理活动中发挥了重要作用，并可作为致癌或肿瘤抑制性调节因子。 近些年，循环血液中miRNA表达与肿瘤相关性的研究越来越多。2008年美国研究者首次报道了循环miRNA有潜力成为实体瘤的新型标志物。之后通过血浆或血清非侵入性获取循环miRNA激...
临床无望or蓄势待发？RNAi技术厚积薄发或为临床带来新的技术洪流
当意识到RNA干扰技术巨大的临床前景后，科学家现在正在鉴定其新的靶点及开发其新的载体。 通过在其发展早期有效的消灭双曲期望，RNA干扰治疗方法策略性的规避现存的技术性的挑战。现在，随着给药途径和临床试验的发展，RNA干扰技术正在向着沉默致病基因这个方向快速前进。Arrowhead制药公司的CSO，David Lewis博士表示，理论证明研究，RNA干扰技术已经可以向临床转化。事实上，RN...
单细胞测序，解密小RNA分子的未知功能
随着科研人员对各种遗传疾病和癌症的深入挖掘，单细胞基因组方法捕获的信息变得越来越重要。卡罗林斯卡学院（ Karolinska Institute）的研究人员近日公布了一种新方法，这种方法可以读取个体胚胎干细胞中短的、非编码RNA序列，有助于人们更好地理解基因如何调控不同细胞类型的发展。相关结果以《Single-Cell Sequencing of the Small-RNA ...
mRNA疫苗：让我们的身体自己“制药”
信使RNA（mRNA）为开发新疗法和疫苗提供了一个潜在的变革范本。在自然界的生命体中，mRNA负责将遗传密码翻译成具有功能的蛋白，控制着每一个细胞的生命进程。mRNA将遗传信息传递给细胞，因此通过编码mRNA使其携带正确的信息，就可以让细胞产生的我们所需的抗病蛋白或是抗体。 mRNA行业的先驱们已经建成了一个临床和临床前数据库，这表明，基于mRNA的治疗可以填补传统的小分子药物、生物治疗和...
培训 | 二代测序在DNA及RNA表观遗传研究中的应用
甲基化是表观遗传学的研究重点，也是复杂转录调控系统中的重要组成部分。在真核生物中，甲基化在正常的细胞发育和维持组织稳定性方面有着重要作用。同时，甲基化还与基因组印记、X染色体失活及肿瘤发生等多种生物学过程相关。 羟甲基化和m6A甲基化是目前表观研究的热点。 hMeDIP-seq是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术，利用该技术可有效地寻找基因组上的甲基化区域，从而比较不同细...