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专家访谈
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BIOTREE 第一届2016组学数据分析美图秀
无论是基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学或是脂质组学，组学的数据收集是科研人员面临的一个问题，但肯定不是最大问题。大多数人都同意，更大的问题是弄清楚组学数据集到底意味着什么。一年辛苦耕耘，在此2016年末之际，尽管组学数据分析仍存在巨大的瓶颈，但正所谓“高手在民间”，BIOTREE特此举办“第一届2016组学数据分析美图秀”的活动，望各位生物达人热烈参与，相互切磋，共同进...
干货！近期国内外药物基因组学发展状况分析
引言 药物基因组学（Pharmacogenomics, PGx）概念的提出已有数十年时间，其主要目的是明确引起个体间药物反应差异的重要基因变异。PGx是目前将基因组信息整合到临床实践、提供临床决策支持的首选领域，因此，国内外的临床医生和产业界开展相关业务的企业对其发展十分关注。近年来，由于测序技术、生物信息学技术以及计算机技术的突飞猛进，也促使PGx研究得到了较快发展...
三大基因编辑技术PK及市场分析，CRISPR技术易产生脱靶效应仍是重要隐患
纵观基因编辑技术市场，其现状与八十年代索尼公司出产的Betamax录像机和JVC公司的VHS录像机之间的磁带格式战争非常相似。在当时虽然大多数专家都认为Betamax录像机更功能丰富、性能更好且更耐用，但是从另一方面来看，VHS录像机的价格更偏宜，并且适用于长时间观影，因此在这场战役中最终的赢家是JV公司的VHS录像机。医疗市场分析公司Kalorama对基因编辑技术和公司进行梳理，动脉网（微信：v...
国际合作项目刊登两篇Cell分析17万人血细胞遗传差异与疾病关系
11月18日在Cell上，2篇 BLUEPRINT 和 IHEC consortia项目支持的里程碑式研究文章显示血细胞与三大免疫细胞的特性和数量如何变化以至于影响一个人出现复杂疾病如心脏病，类风湿性关节炎、哮喘、腹腔疾病和1型糖尿病这些自身免疫性疾病的风险。 连同其它发表在别的高影响力期刊的文章，这是一个为期五年研究带来的高潮，£2500万（€3000万）的项目...
全基因组连锁分析和高通量测序结合寻找疾病相关基因
在寻找疾病相关基因的研究中，使用基因芯片对家系进行连锁分析，将基因定位于少数几个区域中，接着进行外显子组测序或全基因组重测序寻找候选区域中的遗传变异，是一个准确高效的研究方案。本文列举了上海交通大学医学院附属新华医院皮肤科李明老师团队的两项研究，均使用了上述方法成功找到了疾病相关的基因变异位点。该研究中的Illumina Infinium Human OminiZhongHua-8基因芯片和...
卢煜明教授PNAS发布第二代无创胎儿基因组分析结果
今年9月，堪称“中国诺贝尔”的未来科学大奖揭晓。香港中文大学李嘉诚健康科学研究所的卢煜明（Dennis Ming Yuk Lo）教授因发现可以从母亲血液中提取到胎儿DNA，而获得高达100万美元的生命科学大奖奖金。 作为无创DNA产前检测的奠基人，卢教授早在1997年就发现了孕妇外周血中存在游离的胎儿DNA，并发展出了一套新技术来准确分析和度量母亲血浆内的胎儿...
遗传疾病连锁分析定位研究方案
在遗传病家系研究中，连锁分析定位是一种稳定可靠的方法。使用基因芯片对家系样本进行分型，并使用连锁分析将遗传病相关基因定位于一段基因区域中，随后再进行测序寻找这段基因区域内的遗传变异，可将候选范围缩小至数个位点。连锁分析通常用于单基因遗传病研究，或者用于定位复杂疾病中致病性高的遗传变异。 研究案例 连锁分析和外显子测序在Dowling-Degos病例...
CAR信号通路的分析
嵌合抗原受体（CAR）T细胞转移作为一种治疗方案已经在白血病和淋巴瘤领域获得了成功，但实体瘤更具挑战性，因为真正肿瘤特异的目标分子很稀少，并且肿瘤微环境是免疫抑制性的。更好地了解CAR信号通路，以及它们与T细胞受体（TCR）信号通路有何不同，才能在未来更好地开发针对实体瘤的CAR策略。内源TCR信号的哪些方面缺失？CAR T细胞和常规T细胞在细胞因子分泌图谱上有何不同？ Bio-techne 旗...
干货分析|国内独立医学实验室的发展现状和趋势
独立医学实验室（下文简称ICL）行业是体外诊断行业产业链的重要一环，现在讨论这个行业的发展趋势是因为和达安基因与迪安诊断上市时候相比，我们认为ICL行业的发展趋势和投资逻辑已经发生了重大的变化。以迪安诊断为代表的ICL行业龙头正在开始新的战略篇章。 ICL作为体外诊断行业产业链的服务端，其发展动态更容易受到政策的影响，对于产品生产企业而言，收费下降将对企业收入和利润端产生负面影响...
Quest和IBM推出肿瘤基因组测序服务；微软云平台使测序分析速度快7倍
Quest Diagnostics公司和IBM Watson Health近日宣布推出一项服务，为美国医生提供肿瘤基因组测序和分析以及癌症治疗建议。这项服务代表着IBM先进的基因组学智能计算平台Watson for Genomics已经不仅能服务于患者和肿瘤学家，而且能广泛地服务于提供大部分癌症治疗的社区肿瘤医生。作为合作的一部分，纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的精...
核酸突变分析方法抉择: PCR、杂交、NGS？
日前，以“精细管理、精准医疗”为主题的2016届CSCO学术年会在厦门落下帷幕，精准检测作为临床实践中实施精准医学的第一步，成为本届CSCO学术年会的热点话题。来自不同企业的分子诊断技术百花齐放百家争鸣，面对新技术与成熟技术的较量，在“精准医学”时代下，如何选择合适的检测技术，实现精准治疗成为新医学形态下人们亟需解决的问题。 近期，美国莱斯大学DmitriyKhodakov教授在国...
首次多组学联合分析人肠道菌群
人类肠道是一个复杂的生态系统：有无数的细菌居住在里面，帮助我们消化食物。最近，来自德国卢森堡大学系统生物医学研究中心（LCSB）的科学家，与卢森堡Integrated BioBank（IBBL）、卢森堡中心医院以及Emile Mayrisch医疗中心的研究人员合作，开发出了一种方法，能够以前所未有的细节，来研究肠道微生物组这个生态系统：他们的新方法可让研究人员通过RNA测序...
我国体外诊断增长空间巨大 未来市场竞争格局分析
据外媒报道，美国南加州大学诺里斯综合癌症中心已经与Springbok Cares合作，为南加州大学青少年及年轻成人癌症计划的患者提供一个独特的虚拟现实计划AYA@USC。 报道称，这项计划的关键点在于通过利用VR技术来提供定制的剧场式和交互式VR体验，以减轻患者的不适和焦虑。AYA@USC计划负责人David Freyer博士表示：“AYA@USC项目旨在帮助治疗整体...
安捷伦科技在 2016 慕尼黑上海分析生化展上展示创新实验室解决方案
安捷伦科技公司（纽约证交所： A）将于 2016 年10 月 10 日至 12 日在上海的 2016 慕尼黑上海分析生化展上展示其最新的创新技术。慕尼黑上海分析生化展是中国领先的实验室技术、分析、生物技术和诊断行业的展览会。安捷伦科技公司所展示的这些业界领先创新技术旨在满足包括中国在内的安捷伦服务市场的特定需求。 从左至右依次为：安捷伦科技高级副总裁兼 CrossLab 集...
遗传分析发现使用了50年的脑癌细胞系身份有误
瑞典Uppsala大学的研究人员利用短串联重复序列（STR）基因分型和基于芯片的基因表达谱技术，比较了ATCC的U87MG细胞系和Uppsala大学的U87MG细胞系，以及约五十年前用来开发该细胞系时使用的肿瘤样本。它表明，ATCC的U87MG细胞系不是神经胶质瘤，而更接近于之前分析过的胶质母细胞瘤样本。这项研究结果近日在线发表在《Science Tr...
CST蛋白翻译后修饰组学分析技术理论及实操培训班邀请函
蛋白翻译后修饰（Post-translational modification，PTM）通过在一个或多个氨基酸残基上加上修饰基团，可以改变蛋白质的物理、化学性质，进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用。无数研究已经证实，翻译后修饰与多种生物学过程及疾病的发病过程密切相关。研究翻译后修饰为探索信号通路分子机制、识别生物标记物、验...
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伯豪生物circRNA芯片—带您畅游“隐秘而未知的RNA平行宇宙”—环状RNA的海洋 促销时间：2016年8月29日- 2016年9月29日 产品介绍： 环状RNA（Circular RNA，circRNA），是一大类具有闭合环状结构的特殊非编码RNA。环状RNA大量存在于真核细胞中，通常具有组织或发育阶段的表达特异性，且多数序列高度保守，是扮演重要调控作用的新...
Genome Biology：23个癌症类型 10000+个肿瘤样本综合分析 指导肿瘤免疫疗法
Li Bo等开发了一种计算方法来研究肿瘤浸润免疫细胞以及它们与癌细胞之间的相互作用。他们关于免疫渗透水平，临床关联以及预测标志物等方面的数据可能预示产生有效的癌症疫苗和检查点抑制疗法。相关实验发表在Genome Biology。 图1. 预测肿瘤浸润淋巴细胞丰富性的计算方法 最近，癌症免疫治疗在晚期肿瘤方面取得了显著成功，但仍有很大一部分患者...
比中国女排更给力！游离细胞分析打造完美NIPT
您认为游离细胞遗传分析可以取代游离DNA分析吗？ A.会，游离DNA分析存在太多漏洞，无法准确检测全部遗传病。 B.不会，游离细胞收集困难，技术水平不够成熟。 C.两种技术将会并存，互相弥补。 1969年，首次在一位准妈妈的外周血中发现了Y染色体，让这对准父母提前知道了自己儿子的性别。也正...
2016年国家自然科学基金项目大数据分析
2016年的国家自然科学基金项目评审结果已经出炉。科学网在已有结果的基础上，结合历史数据，对基金在不同空间尺度的分布情况进行全面考察，多角度探索科学基金分布特征。 （一）按项目类别统计2015-2016年项目数量变化趋势 根据国家自然科学基金委8月17日通告显示，共接收项目申请172843项，经初步审查受理169832项，决定资助其中的37409项，约占总数的22...