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全基因组测序:公共健康管理的新工具
最近,美国德克萨斯大学的研究人员开发了一种新的NGS病原追踪技术。研究人员希望该技术可以对大规模传染病的爆发起到有效的预防与控制作用。该研究的对应论文名为:Whole Genome Sequencing for Genomics-Guided Investigations of Escherichia coli O157: H7 Outbreaks,...
视频专访:鹍远基因张鹍&刘蕊 强大的技术储备是企业发展的助推力
近日,在两篇文章引起了学术界的极大关注,一篇是发表在Science的《Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain》,另一篇是发表在Nature子刊的《Quantitative comparison of DNAmethylation a...
产业风云再起——基因测序
基因测序领域再迎重大突破 近期有关基因测序领域的利好消息接连不断,相应基因测序板块的个股也有异动,如马应龙就于6月28日强势涨停。新华社消息,美国国家卫生研究院日前批准了首个利用被誉为“基因剪刀”的CRISPR基因编辑技术来治疗癌症的人体临床试验,让这种目前备受关注的生物医学技术在美国距临床试验仅差美国食品和药物管理局批准一步之遥。业内人士指出,美国首次核准将...
华大基因张晓平:测序技术如何助推精准医学
6月18号,我国唯一一个获批建设的国家级基因库投入试运行,目前数据和样本储存在华大基因总部。而前不久,华大基因已在武汉发布测序应用整体解决方案BGISEQ-500n,这是全球首次大批量列装“中国造”。 测序技术在精准医疗中的应用方向有哪些?NGS推动精准医学的痛点又在哪?在火石创造的基因系列沙龙中,华大基因副总裁张晓平做了主题演讲——测序技术助推精...
中美合作Sparc新软件弥补三代基因测序“硬伤”
中国科学院昆明动物研究所“计算生物与医学生态学科组”研究员马占山与美国马里兰大学博士叶承曦在基因测序领域的合作取得新的突破。针对第三代基因测序仪硬件错误率高达15%~40%的现实,该团队研发出了一套“线性复杂度”的算法,这套算法复杂性最低,基于该新算法完成了Sparc软件的开发。 Sparc软件能够有效弥补三代测序技术硬件超高错误率这一“硬伤”,大幅度提高三代技术的市场竞争能力,为迎接基因测...
讲道理,现在的个人基因测序服务,比星座什么的高在哪里?
千钧一发 1997年上映的科幻电影《千钧一发》(Gattaca)中描述了这样的未来世界: “在不久的将来,人类是经人工搭配基因孕育而成,剔除掉不良的基因。未经人工筛选基因而出生的人则被视为“病人”。一个人的潜力自出生开始就被确定,并会根据基因显示的潜力来安排适合工作。主角正是所谓的“病人”,他为了参加Gattaca企业的太空计划而假扮精英成员的基因身份。” 《...
通知 | “中国高通量测序Cancer panel标准化体系”建立及应用研讨会
随着肿瘤疾病的高发,高通量(High-throughputsequencing,NGS)技术在肿瘤疾病领域的作用愈发重要。风险评估;早期诊断;耐药评估;预后判断;基因信号转导的交互作用等都需要建立测序标准化及大数据的分析体系。 为建立中国人群Cancer panel标准化体系,推进精准医疗产业化,全国卫生产业企业管理协会基因技术...
精准医疗时代已至 基因测序数据分析成为关键
随着医学技术提升、就医环境改善,困扰人们的复杂疾病是否能够得到更加有效的治疗?相关统计显示,针对城市居民死亡率较高的癌症(恶性肿瘤)、心脏病、冠心病等复杂疾病,传统医疗方案的治疗效果并不佳。据WINSymposium公布的数据显示,传统医疗在肿瘤治疗上用药无效率高达75%。人们仍然谈“癌”色变。因此,立足大数据、强调个性化的“精准医疗”势在必行。 &e...
全基因组测序在临床感染疾病研究中的应用
感染病分子诊断中,PCR是公认的首选技术。然而全基因组测序(WGS)可能会超越PCR成为首选。在今年举行的欧洲临床微生物学和感染病大会(ECCMID)上,关于该技术的科学研究展示数量迅速增长,正好证明了这一点。 大会上研究人员从多个方面探讨了WGS在临床中的应用,包括帮助预测耐药性,促进流感疫苗研发并对个体患者的流感严重性提出新假说,诊断和建立肺结核耐药...
绿叶旗下基因测序公司收购美国Lifecode核心业务
绿叶集团旗下的基因测序公司Vela Diagnostics近日宣布,收购位于美国加利福尼亚州Foster City的一家癌症分子诊断公司Lifecode Inc的数据分析业务。 Vela Diagnostics的此次收购使其能够使用Lifecode的数据集成网络,数据分析和结果报告一系列产品组合。这不仅标志着Vela Diagn...
达安基因联合暨南大学 开启基因测序&分子营养学的健康密码
6月27日,达安基因与国内科研实力雄厚的暨南大学重磅联手,成立了“疾病易感基因与饮食健康联合研发中心”。达安基因与暨南大学把基因测序技术与分子营养学有机地结合起来,开启基因测序+分子营养学的健康密码。为此,我们对达安基因大众基因产品事业部总经理陈英杰以及参与该项研发的暨南大学陈龙博士进行了专访。 揭牌仪式 疾病易感基因与饮食健康联合研发中心牌 ...
Nature Biotechnology最新文章:DNA甲基化测序技术比较研究,促进甲基化标记应用精准医疗
在不同疾病中,DNA甲基化具有不同的模式。DNA甲基化的具体模式通常与诸如疾病亚型、疾病预后以及药物反应等临床信息具有一一对应的联系。在多种癌症的治疗过程中,DNA甲基化生物标志物可以帮助临床医生选择恰当的治疗方式。 对于拥有成千上万个样本的大量病人来说,全基因组映射与DNA甲基化分析是非常合适的。同样,DNA甲基化分析对于表观基因组学关联性...
Science:最大规模的人脑单细胞测序计划首获成功,大力推动脑部疾病个体化诊疗
2016年6月24日,一项发表在在线出版的Science杂志上的研究开发了首个大规模高效方法用于人类大脑神经性元不同亚型的鉴定,奠定了“绘制”人脑神经元细胞基因活性方法的基础;同时,可以帮助我们更好的理解人脑正常功能及疾病异常,包括阿尔茨海默氏症、帕金森症、精神分裂症和抑郁症等。此篇论文的通讯作者是来自美国加州大学圣地亚哥分校(UCSD)的张鹍教授。 该研究通...
基因测序“摩尔定律”初现,“三代测序”要革“二代”的命?
在“二代测序”(NGS)尚未迎来投资热潮的情况下,技术突破捷报连连的“三代测序”(3GS)又进入到了投资人的视野中。1986年,第一台商用基因测序设备正式出现,到第二代测序设备出现,期间间隔了19年时间。而第二代设备问世,到第三代设备的诞生,仅仅用了5年,基因测序设备的更新换代速度正在不断加快。这就好比“2G”手机跳过“3G”,直接跨越到了“4G”时代。 报告通过四个方面对第三代基因测试技术...
《Nature》中国特辑——中国首先攻克了DNA测序,现在又想统治精准医疗
六年前,中国成为了DNA测序的全球领袖——当时都归功于一家企业,华大基因(BGI)。在那时,这家位于深圳的公司刚采购了128台全世界最快的基因测序仪,据称拥有全世界DNA解码能力的一半以上。华大基因组织了一支初出茅庐的青年生物信息学家大军,与全世界顶尖研究人员合作,发表了从远古人类到大熊猫等各种生物的基因测序结果。这家公司迅速得到了基因组暴力测序工厂的名声;一些人认为他们的成就...
中国首个高通量测序863项目示范基地成功启动
2016年06月18日,首届国际痴呆与认知科学高端论坛在深圳隆重举行。本次会议上,由华因康基因牵头发起了 “863项目示范基地(老年痴呆症方向)”项目启动仪式,该仪式也在众多领导和专家的见证下成功举办。 图1 会议现场 深圳市公立医院管理中心张丹书记、深圳市卫生和人口计划生育委员会孙美华主任、深圳市科技创新委员会陈献梅处长...
全基因组测序—防治结核病新利器
肺结核最初由古希腊人发现,由于肺结核患者的体重通常都会急剧下降,当时的人们认为肺结核是一种过渡消耗自身的表现。现在,肺结核仍然在困扰着全球三分之一的人口,每年都会带走大约150万人的生命。跟踪疾病的爆发疫情对于控制肺结核这种致命疾病的感染与传播至关重要。 最近,一个来自不列颠哥伦比亚大学伦敦帝国学院的科研团队相信他们的科研成果能够永久性地解决肺结核爆发疫情跟踪的问题,准确地对疫情是否结束...
MIT: DNA测序对于每位癌症患者病人都是是必需的吗?
为了提高药物与癌症患者的匹配度,一家公司打算提供免费基因检测。 一家名叫Strata Oncology的公司声称,它将为100,000名癌症患者提供先进的基因检测。但是这里也有利益驱动:它希望能够找出具有特定稀缺DNA错误的患者,并将它们介绍给制药公司。 去年刚刚创办的Strata,已经从投资者那里筹集一千二百万美元,并且声称一年可以进行50,000份新一代测序。这种测试可以探测肿...
基因测序里还有哪些技术“劫”?
日前,一些从事医疗投资和基因组医学研究的学者在艾瑞咨询主办的“基因测序赛道扫描沙龙”上探讨产业发展上的技术“劫”,希望明晰产业发展“路线图”。 2016年3月,在科技部发布的重点专项申报指南的相关通知中,将“精准医学研究”列为2016年优先启动的重点专项之一,支持以基因测序为基础的精准医疗行业。 &e...
据说是世界上最小的PCR检测仪
无论是医疗诊断,还是环境检测,人们都需要小巧便携的检测设备。因此,体积小巧的PCR检测仪应运而生。近日,加拿大Spartan Bioscience公司就推出了一款号称是世界上最小的分子诊断设备。 这款名为Spartan Cube的仪器顾名思义,就是一个立方体,长宽高都是4英寸,也就是10 cm。整台仪器就像一个马克杯那么大,放在实验室、诊所自然没问题,你甚至可以带去亚...