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专家访谈
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IBM开发新型纳米测序仪，实现更低成本！
IBM的T.J.Watson研究中心与亚利桑那州立大学（ASU）生物设计研究所合作开发一款新型测序仪，希望让基因组分析成为一种常规实验分析。 亚利桑那州立大学物理学教授Stuart Lindsay说：“我们的目标是，让每个医生的办公室里都有功能完备但廉价、易用的DNA测序设备。”价格廉价测序仪能使基因组测序广泛应用...
测序技术CPT-seq：转座酶拯救测序短读取
现在绝大多数DNA测序仪生成的是短序列读取。虽然它们的效率很高，但有许多生物学问题是短片段解决不了的，需要更长的序列信息。日前，Illumina公司的Frank Steemers领导研究团队找到了一个简单的解决办法。他们用一种转座酶把短片段暂时结合起来，保留了序列顺序或邻近性（contiguity）。 在基因组DNA上，不同个体的单碱基差异被称作单核苷酸多态性（SNP）。相邻S...
IBM与ASU联手开发出低成本的测序仪
亚利桑那州立大学（ASU）的Biodesign研究所和IBM的Thomas J. Watson研究中心的科学家已开发出一种DNA测序的原型设备，能够让全基因组分析成为医学中的日常实践。 “我们的目标是将便宜、简单而强大的DNA和蛋白诊断设备放到每位医生的办公室中，”ASU的物理学教授Stuart Lindsay谈道。这种技术将迎来个性化医疗的时代，...
奇点大牛再爆料：5年后基因测序成本仅1毛
11月24日，奇点大学生物技术和信息学项目负责人Raymond McCauley在太庙正殿举行的百度BIG课堂上，向大家讲述生物技术的现实和可预期的未来应用。McCauley的主要研究方向是低成本生物技术应用，在他的研究里，生物技术并不只属于科研人员，每个普通人都可以使用它，而随着生物技术成本的降低，未来的普通人用生物技术来提升生活质量，可能就像今...
Fluidigm推出高通量单细胞mRNA测序流程
Fluidigm公司近日在美国神经科学学会的会议上宣布推出一个新流程，能实现高通量的单细胞mRNA测序。这个流程综合了集成流体通路（IFC）设计的显著进步，可大规模提高通量和易用性，同时降低单细胞制备的成本。据介绍，商业化的产品有望在2015年上半年推出。 Fluidigm的CEO Gajus Worthington...
《转》访傅启华：下一代测序技术在罕见病分子诊断中的应用
深秋，一个阳光明媚的下午，我们如约来到上海儿童医学中心。一进医院大厅就感受到了别样的氛围，很多家长带着孩子在医院看病，虽然人多嘈杂但整体还比较有秩序。 在儿科转化医学研究所见到了傅老师，傅老师为人热情、谦逊，整个专访在轻松的氛围中进行。 转化医学网：作为一所儿科转化医学研究所，相比其他的转化医学中心有什么特点或优势？ 傅启华：我们面对...
盘点：新一代测序，今年又有啥变化
花开花落，又是一年，是时候盘点一下新一代测序领域的新变化了。自今年2月份以来，测序仪并没有太大的变化，但也不是说一切都是老样子。新的样品制备仪器正揭开面纱，而测序读长更是逆了天。 罗氏454 454生命科学曾在2013年宣布，计划在2015年停止测序硬件的销售。据罗氏诊断的测序销售经理Susan Ulanowicz介绍，该公司将支持其硬件直到20...
Sanger团队成功测序人脑绦虫
惠康基金会Sanger研究所为中心的研究机构对欧猥迭宫绦虫进行了测序和蛋白组学的草图绘制，研究样本来自病人大脑中匍匐着的绦虫。 根据研究团队今天在Genome Biology 网络版的报告，研究人员通过针对性条码基因测序技术找到了引起患者症状的脑绦虫，该患者年龄为50岁并长期患有头痛和神经疾病。研究人员对绦虫样本进行了基因组测序，得到了一个总数据量高达1260万的欧猥迭宫绦虫基因组装配草...
埃博拉基因测序难为“无米之炊”
随着埃博拉病毒横扫西非，科学家缺乏重要基因数据来解答引发众多担忧的猜测：这种病毒会变得更具传染性和更致命吗？它会发生变化，让其逃避诊断测试或疫苗吗？非洲和欧洲实验室的冰箱里存放着取自埃博拉患者的数千份血液样本，但它们并未被使用，且少数几个获得新基因数据的研究小组并未公开信息。 研究人员渴望近距离观察病毒可能是如何进化的。英国爱丁堡大学研究传染病的进...
CG新技术在罕见病诊断上的应用
罕见病，顾名思义，是指那些仅发生在极少数人身上的罕见疾病。大部分的罕见病都是慢性的遗传疾病，由突变或遗传的基因缺陷而引起。就目前而言，许多罕见病都缺乏有效的治疗手段和资源，且往往非常严重，因此，罕见病的诊断和预防就显得十分重要。 2014年11月7日，第二届国际罕见病研究联盟会议在深圳福田大中华喜来登酒店召开。来自欧洲、美洲、非洲和亚洲的超过600...
雪貂基因组测序加深人类疾病研究
近日，一个国际研究团队进行了雪貂基因组测序,他们认为这将巩固雪貂作为研究人类呼吸道疾病如流感和囊性纤维化的生物模型。 研究人员检查了雪貂感染大范围流感病毒后基因随着时间推移的不同表达，通过研究囊性纤维化雪貂模型反映了人类疾病的发展。 基因分析中心的合著人Federica Di Palma在一份声明中表示“通过创建一个...
高通量测序的十年：从科研进入临床
高通量测序的推出背景： 2004年全球多个国家共计预算30亿美金的人类基因组测序完成以后，发现单单完成一个人的基因组序列还远远不足以理解人类自身及疾病的机理。由于有了已经完成的人类基因组当做参考基因组，采用廉价、快速的方法对多个样本、群体、病种基因组的比对测序就能提供大量有价值的科研和临床信息。这就要求测序价格足够低、速度足够快，然而对测序结果是否易于拼接、组装基...
【人类基因组计划】解密上帝的语言 天使or魔鬼？
DNA测序时代开始 虽然早在1953年，沃森和克里克就发现了不朽的DNA（脱氧核糖核酸）双螺旋结构，但是长久以来，人们始终都找不到很好的办法测定DNA中四种碱基——A（腺嘌呤）、T（胸腺嘧啶）、G（鸟嘌呤）、C（胞嘧啶）——的排列顺序。 上帝的语言是如此的小，还没有人看得到，天才，鬼才就是为大问题而生的。咿~呀~ ...
Nature：新测序技术有助发现基因组微小变异
领导这一研究小组的是华盛顿大学基因组学系教授、霍华德-休斯医学研究所研究员、弗雷德-哈钦森癌症研究中心人类生物学部兼职教授Evan Eichler博士，其主要从事于基因组学与生物信息学研究，是国际上进行人和其他灵长类动物比较功能基因组学与生物信息学研究的顶尖科学家。在Cell, Nature, Science等国际顶尖学术期刊上发表了具有重要影响力的论文260多篇。 Eichler说：“...
线粒体基因组测序有助筛选青光眼治疗靶点
青光眼是导致不可逆性失明的主因,该病在世界范围内的影响超过了6000万人,估计到2020年会增加到7960万人。人们认为遗传起源和许多实验表明的新的测序方法可以帮助了解该疾病发展状况。 研究组使用新的基因测序技术获得了线粒体基因组数据。开角型青光眼是最常见的青光眼，该种病型表明线粒体已发生突变,...
达安基因取得基因测序仪及无创产前检测试剂盒注册证
达安基因11月6日午间公告，该公司取得了国家食品药品监督管理总局（CFDA）颁发的两个医疗器械注册证，分别为基因测序仪和胎儿染色体非整倍体21三体、18三体和13三体检测试剂盒（半导体测序法）。 达安基因表示，目前，相关市场尚处于开发阶段，市场需求存在不确定性。今年6月，CFDA曾首次批准了批准华大基因两款基因测序仪和胎儿染色体非整倍体 （T21、...
【独家首发】CFDA：达安基因测序仪和21/18/13三体检测试剂盒获准产批件
据CFDA官网11月5日最新消息，达安基因股份有限公司基因测序仪和唐氏无创检测试剂盒获得准产批件。原文如下： （转化医学网360zhyx.com） ...
新一代测序技术用户调查：瓶颈与影响购买的因素
今年The Scientist杂志与另外一家国际市场情报与咨询公司Frost & Sullivan合作，展开了一项新一代测序技术NGS使用情况的用户调查活动。 调查结果显示，目前大部分新一代测序技术研究工作主要集中在基础研究和疾病相关的研究方面。这一调查受访者中约有40%的研究人员参与了新一代测序研究，不过下半年的人数可能还会增加4%，还有一半受访者表...
Cell重要测序文章：Y染色体的惊人发现
科学家们对小鼠的Y染色体进行了一次详尽的测序，揭露了这种数量惊人且生物学复杂的动物，同时提供了一些有关哺乳动物性染色体间激烈的霸主之争的独特的见解。这一研究成果在线发表在10月30日的《细胞》（Cell）杂志上。 Whitehead研究所所长David Page谈及小鼠Y染色体时说：“这是迄今为止测序过的技术难度最大、结构极为壮观的东西。” Page对这种测序挑...
基因测序万亿蓝海：国产测序仪能替代进口吗？
基因测序是一个革命性技术，所带来的应用领域非常宽广，是一片未开发的蓝海领域。近几年来，随着基因测序技术的进步，基因测序行业进入高速发展时期。 在基因测序产业链中，最上游基因测序仪的研发和生产是产业的命门，长期以来，基因测序仪的生产一直被国外所垄断，而从今年开始，中国制造的基因测序仪将逐步替代进口，打破国外的垄断。中科院基因所任鲁风博士在投资交流会上透露，国产替代进...