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专家访谈
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大型研究为癌症基因组分析奠定基础
12月9日，国际癌症基因组协会（ICGC）在著名的《Nature Communications》杂志，发表了一篇令人瞠目的文章，它为即将到来的癌症基因组学研究时代，奠定了基础。该项目，是由Centro Nacional de Analisis Genómico (CNAG-CRG)和German Cancer Research Center (DKFZ)...
【盘点】癌症基因组研究亮点研究速览
癌症基因组图谱计划（The Cancer Genome Atlas，TCGA）是国际癌症基因组联盟（International Cancer Genome Consortium）最大的项目。该项目于2006年启动，耗资1亿美元，目的是绘制1万个肿瘤基因组图谱。如今来自16个国家的科学家合作完成了该项目，揭示了近10000个与癌症相关的基因突变。下一步科学家们该做什...
Cell、NEJM发布癌症基因组图谱重要成果
癌症基因组图谱(TCGA)计划的科学家们，确定了两种最常见肾癌的分子特征，并分类了这一疾病的几种亚型。 乳头状肾细胞癌(PRCC)占每年肾癌病例的15-20%。长期以来它被分为1型和2型两类，然而直到现在科学家们还是基于从这一疾病一些罕见遗传形式获得的信息来了解PRCC的基础遗传学。对无肾癌家族史的病例的分子背景却知之甚少。当前，对于晚期PRCC没有有效的治疗方法。 ...
Cell & NEJM：全球癌症基因组图谱计划又一研究突破 阐明致死性肾癌的发病机制
最近，发表在国际杂志the New England Journal of Medicine上的一篇研究论文中，来自从事癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas）研究计划的科学家通过进行研究，对第二种常见类型的肾癌的两种类型进行了分子特性的分析，并且对这种常见类型的肾癌进行了不同的分类。 每年乳头状肾细胞癌 (Papi...
Plos Comput Biol:科学家利用大数据发现新的癌症驱动基因
近日，来自美国的科学家将两个开放的"组学"数据库进行了整合，得到了一个新的癌症驱动基因目录。相关研究结果发表在国际学术期刊Plos Computational Biology上。 癌症驱动基因是一类一旦发生改变就有可能促进癌症进展的基因，研究人员使用癌症突变基因与蛋白质结构数据库在病人肿瘤中发现了导致正常蛋白间相互作用发生改变的基因突变。通过这种方法...
癌症基因图谱的发展及其意义：坏运气？新希望？的发展及其意义：坏运气？新希望？
Onclive 近期邀请哈肯萨克大学医学中心John Theurer癌症中心的Andre Goy博士以“癌症与基因突变的关系及未来前景”的主题发表了评论性的文章。文章在整体层面上介绍了癌症与基因突变的关系，一些新的观点和实验进展。 癌症是一个复杂的多样的病理学和生物学的集合，但从基因水平上说，癌症是体细胞基因突变累积到一定...
NIH资助研究癌症基因组云系统
传统上，基因组数据分析需要将数据下载储存在多个地方，然后协调这些数据，之后才能在本硬件上进行计算。然而，涉及下一代测序技术的大规模项目的生物医学数据，已经使这种模式显得十分笨拙。 为了解决这个问题，2014年NCI启动了一项构建基因组数据储存库的项目，该项目由于扩大了癌症研究的群体，使研究变得更加便捷与广泛。 &ems...
美国国立卫生院或资助研究癌症基因组学云项目的测试
近日，来自美国国立卫生研究院宣布了一些资助项目的计划，这些计划将会有效利用国立癌症研究所的癌症基因组云领航（Cancer Genomics Cloud Pilots）项目来帮助评估和开发一些数据管理基础措施。 从传统意义上来讲，基因组数据分析包括将下载的数据存储于多个位置，尝试协调这些数据，随后在当地的硬件上对数据进行计算分析...
香港理工研发大数据分析平台揭示癌症基因关系
２３日从香港理工大学获悉，该校癌症基因组的大数据分析取得重大突破，通过建立一个创新的大数据分析平台，分析基因之间的相互作用，揭示在癌症中基因网络的失控机制。 这项突破是理大医疗科技及资讯学系讲座讲授翁一鸣、陈颖志和黄思铨联同哈佛大学生物统计学专家所组成的研究团队所取得的成果。 研究团队还发现诊断及治疗慢性骨髓细胞白血病的潜在标靶基因——核磷蛋白（ＮＰＭ１）及...
Cell：癌症基因组计划再取重要成果
来自德克萨斯大学MD安德森癌症中心的研究人员称，他们将最致命的皮肤癌类型――黑色素瘤分为了4个不同的基因亚型，这一研究发现有可能会在寻求个体化医疗领域体现它的价值。这项研究是癌症基因组图谱计划（TCGA）的一个组成部分，研究人员将他们的成果发布在6月18日的《细胞》（Cell）杂志上。 研究人员通过分析从331名患者处获得的样本，根据突变...
普通人该不该做癌症基因检测
癌症越来越常见。有人说癌症和糖尿病一样是富贵病，是因为人均寿命提高了，很多人活到了得癌的岁数。这只是原因之一，此外还有癌症诊断技术的改进，特别是早期诊断技术的改进，使得很多人身体内的癌症被早期发现。总而言之，我们死于癌症的可能性会越来越高。 癌症是一大类疾病的总称，其共同点是失去控制的细胞增殖。在正常情况下，我们体内的细胞会增长、分化和死亡，但癌症细胞只增长和分化...
Nature子刊意外发现：癌症基因组的第二面
来自芬兰赫尔辛基大学和瑞典卡罗琳斯卡学院的研究人员发现了在癌症中人类调控基因组内从前未确定特征的一些突变模式。研究论文发布在6月8日的《自然遗传学》（Nature Genetics）杂志上。 由赫尔辛基大学的Lauri Aaltonen教授和卡罗琳斯卡学院的Jussi Taipale教授共同领导的这项研究，是建立在对200多个大肠癌样本进行全基因组调查的基础上...
罗氏NimbleGen综合性癌症基因捕获进行全面癌症突变检测
个人化癌症治疗是癌症治疗的发展方向与研究热点，相关的各种分子检测方案的发展迅猛。美国一个癌症中心开发了一个两步法方案用于指导药物选择、选择合适的患者参加药物临床实验。 这两步检测法包括：第一步，对少量癌症基因的突变热点进行测序，这些基因通常有较为明确的针对性治疗方案或者靶向药物，此作为快速的初步筛选，使通过筛选的患者可以参与到新药的临床实验中。第二步，对超过200个...
IBM的Watson系统开始用于癌症基因组学分析
Lukas Wartman博士在对抗癌症的基因战争上从零开始。圣路易斯华盛顿大学癌症基因组学的副主任开发了他自己的急性淋巴细胞性白血病。 制定治疗方案时，他的同事看着他的DNA和RNA（将DNA转变成蛋白质的化学信使），试图给他第二次机会。这是一个需要几个月时间的艰巨的过程，并需要一些研究人员的专用脑力，但...
图解：“癌症基因检测”新技术靠谱吗？
【新民晚报·新民网】2月4日是国际抗癌联盟发起并设立的“世界癌症日”。最新统计显示， 我国目前每年新增350万癌症患者，每年癌症死亡人数达250万人，在部分城市，癌症超过了心血管疾病，成了致人于死地的“第一杀手”。值得注意的是，中国的癌症患者被确诊时，绝大多数已处于中晚期。于是，近几年，一种叫“癌症基因检测”的新技术，悄然在城市里流行起来。 “安吉丽娜效应”...
癌症基因组项目(TCGA)完成之反思
经过美国不懈的努力，涉及上万个癌基因的癌基因组项目正式告一段落。该项目在2006年开始，预计花费1亿美元进行研究，并且癌症基因组图谱（TCGA）现在已经成为国际癌症基因组协会最大的组成部分，该项目汇聚了来自16个国家的科学家，并发现了接近10万个与癌症相关的基因突变。 现在的问题是，下一步怎么办。一些研究人员希望继续关注测序；而另...
“10,000个癌症基因组计划”宣告完成
旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”（The Cancer Genome Atlas，TCGA）计划已正式宣告结束。这一于2006年启动，耗资1亿美元的研究项目现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer Genome Consortium, ICGC)研究计划最大的组成部分，来自16个国家...
ICGC应用云平台深化开放其癌症基因组数据
国际癌症基因组协会(ICGC)在声明中表示已经选择了Annai系统在1万个ICGC所产生的人类癌症基因组项目中进行数据收集。 ICGC数据都会出现在基于云平台ShareSeq的Annai系统中，该系统将在短期内增加额外功能，支持研究人员联合分析他们自己的研究数据与ICGC数据库中的数据。 根据ICGC的声明，该项举措...
黑莓手机合作打造个人癌症基因组浏览器
黑莓公司是智能机领域的先驱，但由于近年在手机业务上的低迷表现，黑莓正不断寻求业务转型，力图探索新的发展点。今年4月，黑莓公司曾宣布已买入少量NantHealth股份，欲与其联手合作推出一款侧重医疗保健的智能手机。 在2014年即将结束之际，NantHealth公布了应用于黑莓Passport智能手机上的NantOmi...
谷歌发福利啦 公司员工及家属可享受癌症基因检测服务
Foundation Medicine公司总裁兼CEO Michael Pellini近期在一次会议声明中表示，在明年的2月份，谷歌公司将为员工进行癌症基因的DNA检测，作为其员工福利计划的一部分。 据报道，谷歌公司员工及其家属如果罹患癌症，将获得进行Foundation Medicine公司FoundationOne 和 FoundationOne Heme系列检测的机...