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如何利用CRISPR研究癌症:筛选癌症新靶标

2018-09-21

一个小小的p63在胚胎发育过程中具有重要的作用,如果缺失它,就会导致出生缺陷,如cleft palette,手指融合甚至肢体缺失。不过一旦这个早期的工作完成,p63就会回归沉默,从那时起安静地待在基因组中,除非它被意外重新激活。而当p63在成人基因组中重新被激活时,结果可能是癌症,之前的研究发现皮肤,肺,乳房和头颈部发现的所有鳞状细胞癌中有超过一半的出现了过量p63活性。 ...

CRISPR-Ca9全基因组脱靶效应检测系统在小鼠身上完成测试

2018-09-14

《自然》本周在线发表的一项研究In vivo CRISPR editing with no detectable genome-wide off-target mutations中,针对CRISPR–Cas9基因组编辑的全基因组脱靶效应的高效检测系统在小鼠身上完成了测试。研究成果有望促进基因组编辑从研究到临床的转化。 VIVO的概述和验证 Akcak...

世纪判决:张锋团队在CRISPR专利案中胜诉,裁定称双方无专利冲突

2018-09-13

美国时间 2018 年 9 月 10 日,美国联邦巡回上诉法院(CAFC)宣布重磅裁定,裁定麻省理工学院张锋教授及其所属的 Broad 研究所拥有的 CRISPR 专利有效,这一决定也是维持了美国专利审判与上诉委员会(PTAB)在 2017 年 2 月的判决。而从专利案的另一团队加州大学伯克利分校及其合作者的角度来看,该裁定对多次主张张锋团队相关专利无效的他们无疑是一个打击。 ...

基于CRISPR的两种核酸检测新工具

2018-09-07

CRISPR技术的两大豪门实验室分别开发出了一种工具。张锋实验室利用Cas13蛋白的天然RNase活性开发和优化了一种方法,包括SHERLOCK和SHERLOCK v2。Jennifer Doudna的实验室则利用Cas2a的非特异性ssDNA降解开发出另一种称为DETECTR的方法。 检测核酸的时候,大家都希望特异性和灵敏度越高越好。然而,目前的检测方法要么缺乏灵...

Science | CRISPR超级大牛Doudna首次发现Cas12a的抑制蛋白

2018-09-07

iNature Cas12a(Cpf1)是一种CRISPR相关核酸酶,对合成基因组工程,农业基因组学和生物医学应用具有广泛的应用。 虽然携带CRISPR-Cas9或CRISPR-Cas3适应性免疫系统的细菌有时获得编码抑制Cas9,Cas3或DNA结合级联复合物的抗CRISPR蛋白的移动遗传元件,但是没有发现CRISPR-Cas12a的这种抑制剂。2018年9月7日,加州大学伯克...

Nat Rev Microbiol:CRISPR-Cas获取spacer的分子机制

2018-09-06

许多细菌和古细菌具有通过将称为间隔区(spacer)的外源DNA的小片段掺入CRISPR基因座从而改变基因组的独特能力。一旦转录并加工成单独的CRISPR RNA,该序列可引导Cas效应核酸酶破坏靶向互补的外源核酸。以上这两个过程被称为CRISPR-Cas免疫应答。 在这篇综述文章中,作者回顾了最近的研究。这些研究有助于人们对间隔物获取的分子机制进行理解,并揭示了C...

最新专利分析:经CRISPR技术改良的通用CAR-T细胞疗法

2018-09-05

-作为新兴的基因工程技术,CRISPR和CAR-T细胞疗法已经在近几年引起了持续的兴奋。 基于CRISPR技术开发CAR-T细胞疗法(图片来源 nature) 其中CRISPR是一种基因组编辑工具,与其他基因组编辑工具相比,其具有更快、更便宜、更准确等优势。而且应用广泛,从农业到基因治疗。CAR-T细胞疗法则是过继性细胞免疫疗...

随着基因疗法进入临床试验,CRISPR基因编辑仍然是在劫难逃吗?

2018-09-03

任何近期观看过哥伦比亚广播公司(CBS)网站上关于引发生物学医学研究变革的CRISPR基因编辑工具的 60分钟视频片段[1]的人都会得出结论:这种基因编辑技术正处于开发出一连串治愈方法的边缘。但是最近的一项研究[2]揭示出在部署这种著名的“分子剪刀”之后,一大堆染色体片段会发生缺失和重排。 CRISPR是2012年发现的,它出色地让细菌抵抗病毒感染。这种“规律间隔性成簇短回文...

如何更好的开展CRISPR研究实现脱靶效应最小化?这里有一份秘籍

2018-09-03

距离首次作为基因组编辑工具仅仅5年,CRISPR几乎就成为了家喻户晓的技术。从一开始作为细菌切除入侵病毒DNA的方式,到现在,CRISPR已经引发了关于动物模型、高通量筛选、转基因生物和基因治疗,甚至是生物医学伦理学和科学专利法的一系列讨论。 所有的一切都在以令人震撼的速度增长。诚然,CRISPR并非没有缺点,但它的优点太多,涉及到其可编程并适用于无数生物、细胞类型...

CRISPR介入抑郁症疗法,将开发副作用更小的药物

2018-08-24

据估计,13 %的美国人服用抗抑郁药物对抗抑郁、焦虑、慢性疼痛或睡眠问题。然而对于1400万患有临床抑郁症的美国人来说,近三分之一得不到相关药物的缓解。近日,华盛顿大学医学院的研究人员正尝试一种基于CRISPR技术的新方法来缓解抑郁症。 图为大脑海马区的一个染有染料的神经元。研究人员正在测试神经甾体药物如何与这些神经元上的GABA受体结合,以开发更好的抗抑郁药物。神...

新CRISPR技术“跳过”潜在致病基因

2018-08-21

伊利诺伊大学的研究人员修改了CRISPR基因编辑技术,触发细胞内部机制在基因转录成蛋白质时跳过基因的一小部分。换句话说,这可以消除突变基因序列,而不影响基因表达和调控。 CRISPR技术通常是在靶基因启动前切断DNA来关闭基因表达,但是当DNA重新结合后,容易诱发突变,这种情况可能导致的新问题包括非预期位置DNA断裂以及断裂的DNA重新附着在其他染色体上。 ...

“即用型”免疫细胞、用CRISPR纳米机器人定位有害菌,盘点巴黎16家“黑科技”生物公司

2018-08-17

21世纪是生命科学的世纪,过去剥夺人类生命的诸多疾病,例如癌症、艾滋病等等,现今都成为了生物公司争相开发新技术、研发新疗法的对象。 CAR-T细胞疗法,人工为T细胞赋能——病原躲避T细胞的识别,人类就“手把手”教T细胞识别并攻击病原体;CRISPR/Cas9基因技术,真正为给人类赋予了“上帝之手”的能力——精准定位基因序列,改造DNA片段。 ...

高光坪教授《Nature》子刊提出CRISPR无疤基因编辑:再次证明可以纠正遗传病中的DNA突变!

2018-08-16

这一研究成果公布在8月13日Nature Biotechnology杂志上,领导这一研究的是麻省大学医学院的高光坪教授。高教授是当今全球基因治疗领域的领导者之一,他早年毕业于四川大学华西药学院,从事基因治疗研究20余年,特别是在腺相关病毒(AAV)基因治疗研究领域取得了杰出成就。文章的第一作者为王丹(Dan Wang,音译)博士。 高光坪教授 ...

悲催 | 张锋可能因为输掉了这2个CRISPR专利权,损失近20亿人民币!

2018-08-09

对于CRISPR专利,一直是加州大学及Broad研究所争论不休的症结,就是因为这个专利,可能涉及到全球达数百亿美元的商业价值,如果谁能获胜,势必会对整个领域占尽优势。就在近期,加州大学获得了两项至关重要的专利权,尤其是使用优化的指导RNA将CRISPR-Cas9核酸酶导向真核细胞中的靶DNA专利,可以对于CRISPR领域的专利产生颠覆的影响。可能因为这个事情,Broad研究所张...

CRISPR/Cas12a有话说:让基因编辑具有更多可能性

2018-08-08

作为一个革命性的基因编辑新工具,自CRISPR技术问世以来,就被广泛应用于各个生物领域的研究中,科学家们亲切的称它为“魔剪”,也正是因为有了这把“魔剪”,科学家们可以随心所欲的操纵基因。 早前,来自美国麻省理工学院的博士后研究员Naama Kanarek及其团队在利用CRISPR/Cas9基因编辑技术筛选甲氨蝶呤敏感性的因素研究中,惊奇的发现癌细胞对甲氨蝶呤敏感性,其中有一个重要的...

CRISPR技术再升级——单碱基的精准编辑

2018-08-08

CRISPR/Cas9基因组编辑系统来源于简单的细菌免疫系统组分,经过改造后可在真核细胞中实现高度灵活且特异的基因组编辑。该系统是单RNA(single-guide RNA, sgRNA) 介导的核酸酶系统,通过靶点特异的CRISPR RNA (crRNA)序列与靶序列进行碱基配对从而引导Cas9蛋白至特定的切割位点进行切割,然后通过经典的非同源性末端接合 (NHEJ) 或同源重组...

华人女学者用CRISPR技术改善遗传性失明

2018-08-08

根据美国Cedars-Sinai医学中心的一项研究首次证明,一种新技术——可通过去除遗传缺陷治疗遗传性疾病,可阻止患有一种遗传性失明的大鼠的视网膜变性。延伸阅读:用CRISPR制备视网膜神经细胞。 Cedars-Sinai医学中心Governors再生医学研究所的一个研究小组,专注于遗传性视网膜色素变性,这种退行性眼病可能导致失明,目前还没有可治愈的方法。研究人...

新型基因编辑技术“PNAs”与“CRISPR”一决高下

2018-08-03

据估计,每年800万儿童患有严重的遗传疾病或出生缺陷。妊娠期间可以通过羊膜穿刺术检测胎儿是否患有遗传疾病,但是,在出生前没有医疗选择可以纠正这些遗传错误。 胚胎发育早期,许多干细胞快速分裂。“如果我们能早点纠正一个基因突变,就能显著地减少突变对婴儿发育的影响,甚至可以治愈这种疾病,”卡耐基梅隆大学医学院化学教授Danith Ly说。 研...

Nature:中国科学家利用CRISPR技术,创造出仅有一条染色体的酵母菌株

2018-08-03

几乎所有已知的天然真核物种都有多条染色体,除了雄性蚂蚁(Myrmecia pilosula)只含有一条染色体。此外,真核生物中染色体的数量变化而与其生物学特征没有明显关联。例如,在哺乳动物中,人(智人)二倍体细胞具有46条染色体,而印度麂(Muntiacus muntjak)的二倍体细胞具有最低数量的染色体(雌性为6个,雄性为7个)。 2018年8月2日,中科院上海植物生理生态研...

Nature子刊:重磅!再也不怕DNA断裂了!新途径彻底解决CRISPR效率问题!

2018-08-02

CRISPR/Cas9技术问世以来,迅速成为生物科学领域的游戏规则改变者,7月31日,第一个成功将CRISPR/Cas9搜索功能用于实践的生物技术初创公司-Mammoth Biosciences赢得了2300万美元融资,更是让CRISPR/Cas9技术进入烈火油烹的境界。然而,该技术导致双链DNA的断裂,一度成为阻碍CRISPR/Cas9技术发展的绊脚石。近日...