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【Cell子刊】表观基因组可作一种治疗策略来预防视力丧失
研究阐明了与杆状感光细胞、视网膜光敏细胞衰老有关的分子变化和生物学途径。未来的研究可以进一步研究如何预防或延缓衰老过程中的视力丧失,并有望降低相关神经退行性风险。 每个生物体都有一个基因组,一个控制人体所有细胞和组织功能的基因库。这些基因的表达(当存储在DNA中的信息转换成用于制造蛋白质或其他分子的指令时)由有机体的表观基因组进行调...
【Nature】国内前列腺癌大规模基因组分析,和老外存在明显差异
近日,海军军医大学孙颖浩院士领衔,于《Nature》在线发表了文章,对208份中国原发性前列腺癌患者的肿瘤组织样品进行研究,解除了一直以来的牵制,结果发现:41%的肿瘤包含FOXA1突变,18%含有ZNF292和CHD1缺失。 作者分析了来自中国的208例经历前列腺癌根治术的原发性前列腺癌患者肿瘤组织,其中177份前列腺癌组织之前未经...
《Nature》子刊:癌细胞的“达尔文进化论”!依靠基因组倍增来不断生长!
导语:癌症的发展可以被认为类似于无性进化,全基因组加倍(WGD)在癌症中普遍存在,涉及整个染色体补体的加倍,然而,关于WGD在癌症进化中的选择压力尚未得到充分研究。 近日,伦敦大学(University College London)TRACERx团队的联合负责人尼基·麦克拉纳汉(Nicky McGranahan)博士领导的研究团队就全基因组...
《cell》:肠道微生物大规模宏基因组研究突破,助力治疗心血管疾病!
导语:肠道菌群是一个动态且高度多样化的微生物生态系统,会影响宿主生理的许多方面,虽然许多研究侧重于单个微生物分类群对机体健康的影响,但它们的整体代谢潜力尚未得到充分的探索。 近日,《Cell Reports》发表一篇文章中,用整合的宏基因组目录对小鼠的肠道微生物进行了全面地研究,通过互补方法重建大量MAG(超基因组组装基因组)以及将16S r...
【研究】利用高通量表型推断基因型进行基因组选择
导读:研究者建立并检验了一种利用高通量表型推断个体基因型的方法,由此推断出的基因型可用于基因组的选择,有利于使基因组选择发生在温室环境中,从而减少育种计划的周期时间。 近日,预印本网站上biorxiv.org上发表重要结果,可利用高通量表型推断基因型,从而进行基因组选择。 在许多育种项目中,对所有的...
【快讯】国家基因组科学数据中心首次公开新型冠状病毒全基因组序列
国家基因组科学数据中心(NGDC)信息显示,1月26日,该中心收录了由中国医学科学院/北京协和医学院病原生物学研究所提供的5株2019新型冠状病毒全基因组序列。 这是自2019年12月该病爆发以来,国内公共数据平台首次公开发布数据。此前科学家陆续获得的2019新型冠状病毒基因组序列一般递交到全球流感序列数据库(GISAID)和美国国家生物技术...
【快讯】15分钟完成个人全基因组测序分析,华大基因联手阿里云创造新纪录!
15分钟可以做什么?可能连一顿早餐都没吃完。而云计算却检测出了人类基因上30亿个碱基是如何排列的。 1月17日,华大基因向外界宣布,在阿里云上搭建的BGI Online平台创下了新的世界纪录:仅用15分钟,即可完成一个高精度的个人全基因组测序全流程。此前,科学界普遍需要120个小时才能完成类似流程,此次加速解码意味着人类向精准医疗迈出了重要一步。 个人全基因组测序(Whole Ge...
超2亿欧元!人体“第二基因组”具有治疗肿瘤的潜力?
编者注:人体内微生物对健康的影响比我们认为的要大得多。癌症,自身免疫疾病,食物过敏,以及肥胖症,均予之有着千丝万缕的关系。一些科学家将微生物组(Microbiome)称为人体的“第二基因组”。 近日,位于法国的风险投资公司Seventure Partners在BIO-Europe会议上宣布,其在微生物组学,营养学领域的融资活动仍在继续。随着众多行业...
2019全球硬科技创新大会生物技术峰会暨第五届中国药物基因组学学术大会圆满闭幕
为深入贯彻落实习近平总书记关于科技创新的重要思想,加快实施创新驱动发展战略,探索科技成果转化的新机制和新模式,破解实现技术突破、产品制造、市场模式、产业发展的瓶颈,推动精准医学、生物前沿技术在临床、医药和人类健康的研究、应用和实践。10月31日-11月1日,2019科技成果直通车(陕西站)西安全球硬科技创新大会、生物技术峰会暨第五届中国药物基因组学学术大会在西安隆重举行。 ...
第三届国际表观基因组学研讨会在上海金山隆重开幕!
会议邀请了 25 名国内外表观基因组学研究的重量级嘉宾,近 300 名研究者参加本次盛会,共同探讨交流表观遗传学领域的最新研究进展。大会开幕式由于文强教授主持。 上海市公共卫生临床中心党委书记卢洪洲教授 上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心党委书记卢洪洲教授代表主办方——上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心对来自世界各地的参会者表示热...
微基因在 ASHG2019 会议展示基于超十万用户的多项基因组研究成果
2019 年 10 月 15-19 日,2019 年美国人类遗传学会年会(ASHG2019,Annual Meeting of the American Society of Human Genetics)在美国休斯敦举行。 美国人类遗传年会是世界上规模最大的人类遗传学会议,每年秋季在美国和加拿大主要城市召开,邀请超过 6500 名来自世...
让癌症治疗更精准---从癌症蛋白基因组学说起
据神刊杂志CA(影响因子:245)发布的2018年全球癌症统计报告[1],2018年全球范围内预计有1819万癌症新发病例和960万癌症死亡病例。整体而言,肺癌是最常见的癌症类型(占整体的11.6%),也是癌症死亡的主要原因(占癌症总死亡数的18.4%)。对于发病率,女性乳腺癌(女性11.6%)、结直肠癌(10.2%)、前列腺癌(7.1%)是占比靠前的癌症。对于死亡率,结直肠癌...
Nature Medicine:肿瘤全基因组测序助力癌症个体化治疗
近年来,随着全基因组测序所需时间和成本的降低,个体化治疗将造福更多的癌症患者。近日发表于《Nature Medicine》的一项研究表明,开发新的机器学习算法对肿瘤全基因组序列信息进行分析,有助于预测患者的预后,帮助患者选择最佳的治疗方案。 全基因组测序(Whole-genome sequencing,WGS)技术可获取患者几乎全部的遗传信息,包括癌细...
与数十位国际大咖面对面!第六届国际三维基因组学研讨会将于10月在北京召开
在基因组学发展中,以“人类基因组计划”和“人类基因组DNA元件百科全书计划”为代表的大规模研究项目,对人类基因组进行了测序,发现了大量的未知基因,尤其是非编码基因,而且发现了超过几十万个不同的基因调控元件。这些基因和调控元件都在三维的细胞核内完成它们的功能。研究表明,细胞核的三维空间结构对基因的表达和调控有着重要的影响。现在,新一代DNA测序技术和染色质交互检测技术的发展,使得...
揭示ARID1A基因的悖论——使基因组不稳定来抑制肿瘤
ARID1A基因失活会导致细胞有丝分裂缺陷。然而,矛盾的是,ARID1A高突变与癌症细胞基因组稳定性并无明显关联。近日,威斯塔研究所的研究人员发现ARID1A失活可通过影响端粒凝聚来选择性消除染色体异常,即通过阴性选择维持了基因组稳定性,也解开了长久以来的关于ARID1A维持有丝分裂完整性与ARID1A突变肿瘤细胞缺乏基因组不稳定性的悖论。 AT丰富结合...
第三届国际表观基因组学研讨会嘉宾报告题目公布
随着人类基因组计划的完成,表观遗传学已成为后基因组时代生命科学研究的前沿。为促进表观遗传学领域的国际学术交流与合作,推动基础研究和转化医学研究进程,由上海市(复旦大学附属)公共卫生临床中心、复旦大学生物医学研究院、上海人类学学会主办的第三届国际表观基因组学研讨会 (The 3rd International Epigenomics Conference) 将于 2019 年 1...
世卫组织关于管理和监督人类基因组编辑的声明
世卫组织(WHO)人类基因组编辑治理和监督专家咨询委员会曾于2019年3月18日至19日召开会议。在那次会议上,委员会在向WHO总干事提交的临时建议中指出,“在这个时候,任何人继续进行人类生殖系基因组编辑的临床应用都是不负责任的。”WHO支持这一临时建议,并建议监管或伦理当局不要批准涉及人类生殖系基因组编辑工作的临床应用请求。 总干事Tedros Adhan...
揭秘肝再生新方法,解除表观基因组修饰的刹车装置!
近日,纽约大学的研究人员发现了一种肝脏再生的新方法。通过敲除表观基因组中抑制“跳跃基因”(即转座子)的一个元件(Uhrf1),可以重新分配表观遗传标记,解除肝再生的抑制,从而加快肝脏再生的过程。这项研究对于开发具有促进肝再生功能的药物具有重要的意义。 转座子能够激活基因组中的一些基因,该研究新发现了一种表观遗传补偿机制,这种调节机制能够保护基因组被转座...
脱靶基因组编辑:基因科学和医学领域的新学科
作者:;王向东 随着基因组编辑技术的不断发展,基因组编辑设计过程中的非特异性基因突变导致的脱靶效应形成了一门新的基因科学学科和医学学科。基因编辑和检测方法,基因改变的解析方法或对照参考的不同,使基因组编辑发生脱靶效应,从而导致不同程度的短期和长期副作用,毒性或动力学改变。对基因组编辑产生的直接或间接的动态脱靶效应的检测,是基因编辑临床应用的关键问题。基因组编...
寻根溯源——蛋白基因组研究全面剖析结直肠癌
随着我国迈入老龄化社会的脚步加剧,加之人们生活方式的改变,结直肠癌发病率和死亡率正在逐年上升,为患者、家庭和社会带来了巨大的身心及经济负担。 近日,贝勒医学院的研究人员利用基因组蛋白组学相结合的分析技术首次对结肠癌的蛋白基因组进行了详尽的分析,全面剖析了结直肠癌相关生物标志物、药物靶点和肿瘤抗原,有助于系统地确定该肿瘤的新型...