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Cell新文章平息CRISPR-Cas长期争议

【组学】 2015-05-11

我们躯体内外的每一寸都布满细菌。事实上，人体携带细菌细胞的数量是人体自身细胞的10倍。许多细菌都是我们的朋友，帮助了我们消化食物和抵抗感染。但对于我们生命所依赖的这些丰富的生物体，还有很多仍有待去了解。在Cell杂志上的一项研究中科学家们最终破解了细菌利用来保卫自身对抗入侵者的基本过程的密码。

Cell发表衰老研究重要成果

【组学】 2015-05-11

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Cell |衰老 |

由马克斯普朗克生物化学研究所(MPIB)的F.-Ulrich Hartl带领的一个协作研究小组，利用微小的秀丽隐杆线虫作为模式生物，分析了整个生命周期中蛋白质组所发生的改变。研究论文发表在5月7日的《细胞》（Cell）杂志上。

3篇Science文章：大规模人类基因表达差异

【组学】 2015-05-11

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人类基因 |表达 |差异 |

在美国国立卫生研究院基因型-组织表达（GTEx）项目的资金资助下，研究人员构建出了一个万众期待的新数据资源，它可以帮助确立个体基因组构成之间的差异对于基因活性的影响以及对疾病的贡献。借助于这一新资源，科学家们可以同时探究许多不同人类组织和细胞的潜在基因组学，并有望为研究和了解人类生物学开辟新途径。

老年痴呆症致病蛋白Aβ42结构得以解析

【组学】 2015-05-11

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老年痴呆症 |蛋白Aβ42 |结构 |

最近，美国伊利诺伊大学（UIC）的研究人员，确定了与老年痴呆症病情更相关的Aβ42蛋白的分子结构。相关研究结果发表在五月四日的《Nature Structural and Molecular Biology》杂志。

减少测序错误，你做对了么？

【组学】 2015-05-11

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基因测序 |

英国格拉斯哥大学的研究人员在16S rRNA扩增子测序的基础上，全面分析了Illumina台式测序仪的错误模式。他们由此找到了消除错误的有效策略，将这一测序平台的主要错误减少了93%。这项研究发表在前不久的Nucleic Acids Research杂志上。

人类基因组测序可在数天完成

【组学】 2015-05-08

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人类 |基因组 |测序 |

两个3英寸×1英寸的玻璃芯片中，保存有包含在16个人类基因组中的惊人数量的遗传信息。上周，有技术人员将这些芯片――被称为flow cell，置入华盛顿大学基因组研究所一台新的基因测序仪中，将会在短短三天时间内完成人类基因组测序任务。

李国红研究组：表观遗传因子CENP-A介导着丝

【组学】 2015-05-08

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CENP-A |着丝粒 |

着丝粒是染色质上一段结构与功能高度特化的区域，在细胞分裂期指导动粒的组装，并在纺锤体的牵拉下实现姐妹染色单体的分离。CENP-A是组蛋白H3在着丝粒区的变体，是着丝粒区建立和发挥功能的关键性的表观遗传因子。

Science惊人发现：新基因能快速夺权

【组学】 2015-05-08

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Science |新基因 |夺权 |

芝加哥大学的科学家们发现，在早期胚胎发育过程中，新生基因能够快速夺取对基础功能的控制权。相关论文发表在五月七日的Science杂志上。

抑郁症基因表达谱分析

【组学】 2015-05-08

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抑郁症基因 |表达谱 |

重度抑郁症(major depressive disorder, MDD)是一种环境与遗传因素共同作用导致多个基因功能失调的复杂疾病, 近期来自西南大学认知与人格教育部重点实验室的研究人员采用多脑区以及基因集合的分析模式, 搜集了前人研究中13个来源于不同脑区的、包含患者与对照组脑转录组数据的数据集, 对其进行基因集富集分析(gene set enrichment analysis). 这将有助于更准确地鉴别MDD患者基因表达程序中的异常, 为疾病的诊断与治疗提供线索与依据。

多篇文章告诉我们miRNA与癌症的相爱相杀

【组学】 2015-05-08

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miRNA |癌症 |

本世纪初，科学家们第一次发现一种微小的非编码RNAs：microRNAs与癌症有关，当时来自耶鲁大学的发育生物学家Frank Slack与他的同事发现let-7 米RNA基因突变会导致细胞分裂增加。其后在2002年，另外一组研究人员又在他们的实验中发现慢性淋巴细胞性白血病样品中常见的基因缺失位于两个miRNA基因座：miR15 和 miR16上。

Nature：大师级牛人用CRISPR构建癌症

【组学】 2015-05-08

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CRISPR |癌症类器官 |

用含有干细胞巢蛋白（WNT、R-spondin、表皮生长因子EGF）的培养基，可以长期培养小鼠和人类的肠道干细胞，生成遗传学和表型稳定的上皮类器官。荷兰艺术与皇家科学院主席、美国国家科学院院士Hans Clevers教授领导研究团队，利用CRISPR/Cas9技术建立了结直肠癌（CRC）类器官。这一研究成果发表在本周的Nature杂志上。

JCB：特殊蛋白控制HIV-1复制的分子机理

【组学】 2015-05-08

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特殊蛋白 |HIV-1 |复制 |

病毒HIV-1的复制需要病毒组分向免疫细胞的细胞膜开启协调性的运动，而在免疫细胞中病毒粒子就可以装配并且最终释放。

GenomeBiol：改进版CRISPR/Ca

【组学】 2015-05-08

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CRISPR/Cas系统 |编辑 |

利用CRISPR/Cas系统进行基因组编辑可以对小鼠受精卵中的小鼠基因组进行直接地修饰，从而开发出高效、快速、一步法产生，且不携带胚胎干细胞的基因敲除小鼠。

一种新型的基于DNA的GPS技术的开发

【组学】 2015-05-08

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DNA |GPS |

传统的基于硅材料的计算过程在近些年来已经得到了很大地改进，但其仍然面临着一些实际的限制，而近日，来自国外的一个研究小组刊登了他们在The Journal of Physical Chemistry B杂志上的最新研究成果，他们表示，基于DNA的指令计算或许可以促进数字时代达到另外一个水平，而研究者们也阐述了他们的目的，就是开发一种新型基于DNA的GPS技术。

幽门螺杆菌是人类胃癌的危险因素？

【组学】 2015-05-08

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幽门螺杆菌 |CagA |干细胞 |

斯坦福大学医学院的研究人员报道了一项新研究，引起溃疡的细菌幽门螺杆菌可以直接与胃干细胞相互作用，进而导致细胞分裂的更快。

便携式DNA测序仪用在埃博拉病毒基因组上

【组学】 2015-05-07

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MinION |埃博拉病毒 |

四月份，Joshua Quick在行李箱里装了三台基因测序仪，登上去几内亚的飞机。这个事实非常惊人：大多数的测序机器作为商业客机货舱内的托运行李在旅行中太重、易损。接下来发生的事更让人印象深刻。Quick使用这些被称为 MinIONs的测序仪从14例患者身上读取埃博拉病毒基因组，在样品收集后的短短48小时内得出结果，这一共用了他12天时间。